RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 FYB2Q5VWT5 728 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 KIAA1211LQ6NV74 962 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 CPXM2Q8N436 756 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 SPATA20Q8TB22 786 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 UBA3Q8TBC4 463 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 GOLGA1Q92805 767 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 TMEM74BQ9NUR3 256 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 FBXO10Q9UK96 956 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 PILRBQ9UKJ0 227 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 HCN2Q9UL51 889 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 STON1Q9Y6Q2 735 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 BICDL2A1A5D9 508 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 LCP1P13796 627 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 ITPKAP23677 461 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 ZNF132P52740 706 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 MFAP3P55082 362 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 MPPE1Q53F39 396 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 SYCP2LQ5T4T6 812 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 SLC23A3Q6PIS1 610 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 TMEM270Q6UE05 265 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 RGL4Q8IZJ4 473 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 SLC2A11Q9BYW1 496 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 SLC32A1Q9H598 525 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 SLC6A14Q9UN76 642 aa21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
ACTB-212ENST00000484841 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 TULP2O00295 520 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 PAEPP09466 180 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 ENGP17813 658 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 PMLP29590 882 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 ZNF445P59923 1031 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 ST3GAL2Q16842 350 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 GEN1Q17RS7 908 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 BSPRYQ5W0U4 402 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 HDDC3Q8N4P3 179 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 MRGPRX1Q96LB2 322 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 CIPCQ9C0C6 399 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 CNGB3Q9NQW8 809 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 WASH3PC4AMC7 463 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 TIMM44O43615 452 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 CEACAM1P13688 526 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 STILQ15468 1287 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 EDEM1Q92611 657 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 HSPA12BQ96MM6 686 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 O00370 1275 aa21.05■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 SYPP08247 313 aa21.05■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 GNSP15586 552 aa21.05■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.05■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 NELFBQ8WX92 580 aa21.05■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 FOXJ1Q92949 421 aa21.05■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 ELOVL2Q9NXB9 296 aa21.05■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 SUSD2Q9UGT4 822 aa21.05■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa21.05■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 E7ENQ6 273 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 M0QYV0 167 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 P4HA2O15460 535 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 TSPAN3O60637 253 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 GNA14O95837 355 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 SERPINF2P08697 491 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 ACADMP11310 421 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 IL12RB1P42701 662 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 RGS7P49802 495 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 SHC2P98077 582 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 FOXC1Q12948 553 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 FUT11Q495W5 492 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 WDR45BQ5MNZ6 344 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 SLC6A17Q9H1V8 727 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 PI4KAP42356 2102 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 MEI4A8MW99 385 aa21.03■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 GIPC1O14908 333 aa21.03■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 PMM2O15305 246 aa21.03■□□□□ 0.96
ACTB-212ENST00000484841 OPHN1O60890 802 aa21.03■□□□□ 0.96
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