RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481220.5

SNHG12-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, human

TSL 3

Gene SNHG12, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG12-208	ENST00000481220	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	LTF	P02788	710 aa		19	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	VWA3B	Q502W6	1294 aa		19	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		19	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM110	Q86TL2	294 aa		19	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		19	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	GABRG3	Q99928	467 aa		19	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		19	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	MIS12	Q9H081	205 aa		19	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	NDST4	Q9H3R1	872 aa		19	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	INVS	Q9Y283	1065 aa		19	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		18.99	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		18.99	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	MED7	O43513	233 aa		18.99	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	ALDH1A2	O94788	518 aa		18.99	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	LATS1	O95835	1130 aa		18.99	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	GNA15	P30679	374 aa		18.99	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	NTSR1	P30989	418 aa		18.99	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	ARHGAP8	P85298	464 aa		18.99	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		18.99	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	GEN1	Q17RS7	908 aa		18.99	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		18.99	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		18.99	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		18.99	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	DACH1	Q9UI36	760 aa		18.99	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		18.99	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		18.98	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		18.98	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	18.98	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	THAP12	O43422	761 aa		18.98	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	BCKDHB	P21953	392 aa		18.98	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	P2RY2	P41231	377 aa		18.98	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	ACADSB	P45954	432 aa		18.98	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	RING1	Q06587	406 aa		18.98	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	KCNMA1	Q12791	1236 aa		18.98	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	18.98	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		18.98	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	ADGRF1	Q5T601	910 aa		18.98	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	RNF43	Q68DV7	783 aa		18.98	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	BEND5	Q7L4P6	421 aa		18.98	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		18.98	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		18.98	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220		E5RJQ4	531 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF806	P0C7X5	589 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	HOXB2	P14652	356 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	GABRG2	P18507	467 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	WAS	P42768	502 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	ENPP2	Q13822	863 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	MPPE1	Q53F39	396 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	PMS2CL	Q68D20	193 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM215	Q68D42	235 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	CHPF	Q8IZ52	775 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	FRMD1	Q8N878	549 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	HMGB4	Q8WW32	186 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	AZIN2	Q96A70	460 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	ST7	Q9NRC1	585 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		18.97	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	KCNJ18	B7U540	433 aa		18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	WASH3P	C4AMC7	463 aa		18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	RHOBTB1	O94844	696 aa		18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	CYBB	P04839	570 aa		18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	NCAM1	P13591	858 aa		18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	CLCN1	P35523	988 aa		18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	PDCL	Q13371	301 aa		18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	KCNJ12	Q14500	433 aa		18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	ELF2	Q15723	593 aa		18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	CCDC6	Q16204	474 aa		18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	C11orf74	Q86VG3	221 aa		18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	DDI1	Q8WTU0	396 aa		18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	RLN3	Q8WXF3	142 aa		18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	SLC39A13	Q96H72	371 aa		18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	GBP4	Q96PP9	640 aa		18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	LHX5	Q9H2C1	402 aa		18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		18.96	■□□□□ 0.63
SNHG12-208	ENST00000481220	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	18.96	■□□□□ 0.63

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