RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436724.5

PTPRF-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRF, Length 2,168 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-207ENST00000436724 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 CAPS2Q9BXY5 557 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 CRISPLD1Q9H336 500 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
PTPRF-207ENST00000436724 ZNF487B1APH4 448 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 SHBGP04278 402 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 RPL22P35268 128 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 ARL4AP40617 200 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 USP46P62068 366 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 ZNF844Q08AG5 666 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 SLC29A2Q14542 456 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 SCD5Q86SK9 330 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 SCML4Q8N228 414 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 RNF139Q8WU17 664 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 CWH43Q9H720 699 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 NMUR1Q9HB89 426 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 RSPH14Q9UHP6 348 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 FBXW11Q9UKB1 542 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 RARGP13631 454 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 C1QTNF8P60827 252 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 DEFB103AP81534 67 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 SKOR1P84550 965 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 CAV1Q03135 178 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 SLMAPQ14BN4 828 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 EFHC2Q5JST6 749 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 KCTD16Q68DU8 428 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 BBOF1Q8ND07 529 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 TTPALQ9BTX7 342 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 ARHGEF4Q9NR80 690 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 COL4A6Q14031 1691 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 OR6C75A6NL08 312 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 VNN2O95498 520 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 RBL1P28749 1068 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 VSTM1Q6UX27 236 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 SLC9A7Q96T83 725 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 VN1R3Q9BXE9 311 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 USP29Q9HBJ7 922 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 OSER1Q9NX31 292 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 SNX10Q9Y5X0 201 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 MYO16Q9Y6X6 1858 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 MYO1CO00159 1063 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 TBC1D4O60343 1298 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 SH2D3CQ8N5H7 860 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 ANKLE1Q8NAG6 615 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 TKTL2Q9H0I9 626 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 WDCPQ9H6R7 721 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 RRN3Q9NYV6 651 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 A0A1W2PQH9 124 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 MTMR11A4FU01 709 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 KCNN4O15554 427 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 ADAM12O43184 909 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 ACRP10323 421 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 BTBD8Q5XKL5 378 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 LRIG3Q6UXM1 1119 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 NUP93Q8N1F7 819 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 TOP1MTQ969P6 601 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 CENPHQ9H3R5 247 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 DTLQ9NZJ0 730 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 CDY1Q9Y6F8 540 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 GOLGA8MH3BSY2 632 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 RIPK2O43353 540 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 TIMP1P01033 207 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 CXCR3P49682 368 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 GAD2Q05329 585 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 GPR17Q13304 367 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 ANKRD22Q5VYY1 191 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 DENND2CQ68D51 928 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 NTAN1Q96AB6 310 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 C8orf48Q96LL4 319 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 C2CD2LO14523 706 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 TRIM66O15016 1216 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 ACSL3O95573 720 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 F9P00740 461 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 STIP1P31948 543 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 GNGT1P63211 74 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 MGAT5BQ3V5L5 792 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRF-207ENST00000436724 SPDYCQ5MJ68 293 aa21.85■■□□□ 1.09
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