RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428527.1

TTC27-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 27, humanhuman

TSL 3

Gene TTC27, Length 687 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27-202ENST00000428527 GSTM5P46439 218 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 TM4SF4P48230 202 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 VPS41P49754 854 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 SEMA3BQ13214 749 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 LAMB3Q13751 1172 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 P3H1Q32P28 736 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 DEF8Q6ZN54 512 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
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TTC27-202ENST00000428527 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
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TTC27-202ENST00000428527 GDF15Q99988 308 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 TM2D2Q9BX73 214 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 ASNSD1Q9NWL6 643 aa6.32□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 OR2W5A6NFC9 320 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 TTC34A8MYJ7 566 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 TLR2O60603 784 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 CAND2O75155 1236 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 PLAUP00749 431 aa6.31□□□□□ -1.4
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TTC27-202ENST00000428527 CTSAP10619 480 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 MMP8P22894 467 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 CCT4P50991 539 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 STIM1Q13586 685 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 OR2C3Q8N628 320 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 ZNF566Q969W8 418 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 CEP83Q9Y592 693 aa6.31□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 PODXLO00592 558 aa6.3□□□□□ -1.4
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TTC27-202ENST00000428527 PIGKQ92643 395 aa6.3□□□□□ -1.4
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TTC27-202ENST00000428527 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.28□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.28□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 PIP4P1Q86T03 277 aa6.28□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.28□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 CDCP1Q9H5V8 836 aa6.28□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 HEY2Q9UBP5 337 aa6.28□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.28□□□□□ -1.4
TTC27-202ENST00000428527 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
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