RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 PKDCCQ504Y2 493 aa21.97■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 ARMCX6Q7L4S7 300 aa21.97■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 SLC2A11Q9BYW1 496 aa21.97■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa21.97■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 EPG5Q9HCE0 2579 aa21.97■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 SLC12A8A0AV02 714 aa21.96■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 O00370 1275 aa21.96■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 HMBSP08397 361 aa21.96■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 PAEPP09466 180 aa21.96■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 CEACAM1P13688 526 aa21.96■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 ITPKAP23677 461 aa21.96■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 FMO5P49326 533 aa21.96■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF445P59923 1031 aa21.96■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa21.96■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 DENND1CQ8IV53 801 aa21.96■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 MRGPRX1Q96LB2 322 aa21.96■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC4Q9HBW1 653 aa21.96■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 STOML2Q9UJZ1 356 aa21.96■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 RAD54BQ9Y620 910 aa21.96■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 STON1Q9Y6Q2 735 aa21.96■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 TPRP12270 2363 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
LIMS1-208ENST00000428064 LATS1O95835 1130 aa21.95■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 ENGP17813 658 aa21.95■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF33AQ06730 810 aa21.95■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 ADIGQ0VDE8 80 aa21.95■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 STARD3Q14849 445 aa21.95■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 GEN1Q17RS7 908 aa21.95■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 DUOXA1Q1HG43 343 aa21.95■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.95■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 UCMAQ8WVF2 138 aa21.95■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 CNGB3Q9NQW8 809 aa21.95■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.95■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 PCDH15Q96QU1 1955 aa21.95■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 P4HA2O15460 535 aa21.94■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 SERPINF2P08697 491 aa21.94■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 CD19P15391 556 aa21.94■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa21.94■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.94■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa21.94■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 CAPN10Q9HC96 672 aa21.94■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 SLC6A14Q9UN76 642 aa21.94■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 CYP8B1Q9UNU6 501 aa21.94■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 ZFHX4Q86UP3 3567 aa21.94■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.93■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 UPK3BL1B0FP48 263 aa21.93■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 WASH3PC4AMC7 463 aa21.93■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 UPK3BL2E5RIL1 263 aa21.93■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 E7ENQ6 273 aa21.93■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 IL12RB1P42701 662 aa21.93■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 HARS2P49590 506 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 STILQ15468 1287 aa21.93■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 FUT11Q495W5 492 aa21.93■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 MPPE1Q53F39 396 aa21.93■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 BSPRYQ5W0U4 402 aa21.93■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 TTI2Q6NXR4 508 aa21.93■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa21.93■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 RNF139Q8WU17 664 aa21.93■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 IRGQQ8WZA9 623 aa21.93■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 NT5C1BQ96P26 610 aa21.93■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 CHD8Q9HCK8 2581 aa21.93■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.93■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 CKAP5Q14008 2032 aa21.92■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 TIMM44O43615 452 aa21.92■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 DAOAP59103 153 aa21.92■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa21.92■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 CETN1Q12798 172 aa21.92■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 LRMPQ12912 555 aa21.92■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 ST3GAL2Q16842 350 aa21.92■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 MSANTD2Q6P1R3 559 aa21.92■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM270Q6UE05 265 aa21.92■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 LMO3Q8TAP4 145 aa21.92■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 UBA3Q8TBC4 463 aa21.92■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 DDI1Q8WTU0 396 aa21.92■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 SLC35F5Q8WV83 523 aa21.92■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 ELOVL2Q9NXB9 296 aa21.92■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 GIPC1O14908 333 aa21.91■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 CFIP05156 583 aa21.91■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 GCNT1Q02742 428 aa21.91■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 CNGA2Q16280 664 aa21.91■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC40Q4G0X9 1142 aa21.91■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.91■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 FOXJ1Q92949 421 aa21.91■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 HSPA12BQ96MM6 686 aa21.91■■□□□ 1.1
LIMS1-208ENST00000428064 SLC6A17Q9H1V8 727 aa21.91■■□□□ 1.1
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