RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC142Q17RM4 750 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-211ENST00000425989 KAZNQ674X7 775 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-211ENST00000425989 SLC9A4Q6AI14 798 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-211ENST00000425989 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-211ENST00000425989 AADACL2Q6P093 401 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-211ENST00000425989 TMCO3Q6UWJ1 677 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-211ENST00000425989 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-211ENST00000425989 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-211ENST00000425989 PCGF5Q86SE9 256 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-211ENST00000425989 CPNE8Q86YQ8 564 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-211ENST00000425989 LRRC49Q8IUZ0 686 aa9.97□□□□□ -0.81
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HDLBP-211ENST00000425989 LZTR1Q8N653 840 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-211ENST00000425989 LRRN4CLQ8ND94 238 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-211ENST00000425989 SPPL3Q8TCT6 385 aa9.97□□□□□ -0.81
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HDLBP-211ENST00000425989 B3GALT6Q96L58 329 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-211ENST00000425989 KLHL5Q96PQ7 755 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-211ENST00000425989 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
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HDLBP-211ENST00000425989 EPB41L5Q9HCM4 733 aa9.97□□□□□ -0.81
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HDLBP-211ENST00000425989 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
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HDLBP-211ENST00000425989 ZMYM5Q9UJ78 669 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-211ENST00000425989 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF148Q9UQR1 794 aa9.97□□□□□ -0.81
HDLBP-211ENST00000425989 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
HDLBP-211ENST00000425989 KIAA1671Q9BY89 1806 aa9.96□□□□□ -0.81
HDLBP-211ENST00000425989 LINC01553A4QN01 128 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 KCNU1A8MYU2 1149 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 TEX28O15482 410 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 IRAK2O43187 625 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 DAPK3O43293 454 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 RAD51CO43502 376 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 LIASO43766 372 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 SEC24AO95486 1093 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 KRT10P13645 584 aa9.96□□□□□ -0.82
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HDLBP-211ENST00000425989 VCPP55072 806 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 ERVK-21P61565 698 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 GUCY2DQ02846 1103 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF33AQ06730 810 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 RAB30Q15771 203 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 SMTNL2Q2TAL5 461 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 HECTD3Q5T447 861 aa9.96□□□□□ -0.82
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HDLBP-211ENST00000425989 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 FAM131BQ86XD5 332 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 PLD5Q8N7P1 536 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 LEMD2Q8NC56 503 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 SLC35B2Q8TB61 432 aa9.96□□□□□ -0.82
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HDLBP-211ENST00000425989 PSMG2Q969U7 264 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 LRRC45Q96CN5 670 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 SLC39A13Q96H72 371 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 TKTL2Q9H0I9 626 aa9.96□□□□□ -0.82
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HDLBP-211ENST00000425989 TLR9Q9NR96 1032 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 MTMR10Q9NXD2 777 aa9.96□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa9.96□□□□□ -0.82
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HDLBP-211ENST00000425989 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.82
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HDLBP-211ENST00000425989 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.96□□□□□ -0.82
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HDLBP-211ENST00000425989 ZNF840PA6NDX5 716 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 MCF2LO15068 1137 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 ADAM12O43184 909 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 MTSS1O43312 755 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 APOEP02649 317 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 LRG1P02750 347 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 POU2F2P09086 479 aa9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 CNPP09543 421 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HDLBP-211ENST00000425989 RPL17P18621 184 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
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