RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419504.5

TNS1-205, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-205ENST00000419504 MARC1Q5VT66 337 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 SCARA3Q6AZY7 606 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 NMRAL1Q9HBL8 299 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 CYP39A1Q9NYL5 469 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 PREX1Q8TCU6 1659 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 RIPK2O43353 540 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 ALDH2P05091 517 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 CXCL8P10145 99 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 NFIAQ12857 509 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 FAM131BQ86XD5 332 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 REPS1Q96D71 796 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 ELOVL6Q9H5J4 265 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 GPRC5DQ9NZD1 345 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 MROH7Q68CQ1 1323 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 FAM205AQ6ZU69 1335 aa13.45□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 UBDO15205 165 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 BMP10O95393 424 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 JCHAINP01591 159 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 KRT6AP02538 564 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 KRT6BP04259 564 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 KRT6CP48668 564 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 PPIL2Q13356 520 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 OSCP1Q8WVF1 389 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 OSGEPQ9NPF4 335 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 STMN3Q9NZ72 180 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 LZTS1Q9Y250 596 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 NFIBO00712 420 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 SERPINE1P05121 402 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 DARSP14868 501 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 EPHX2P34913 555 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 CHMP1BQ7LBR1 199 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 APOPT1Q96IL0 206 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 ENOPH1Q9UHY7 261 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 MICAL2O94851 1124 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 SERPINF2P08697 491 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 PCNAP12004 261 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 CSHL1Q14406 222 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 NCF4Q15080 339 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 RETSATQ6NUM9 610 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 STARD8Q92502 1023 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 VAT1Q99536 393 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 INTS13Q9NVM9 706 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 TSPAN16Q9UKR8 245 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 RAD51BO15315 384 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 GP5P40197 560 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 TBX4P57082 545 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 ZCWPW2Q504Y3 356 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 C10orf53Q8N6V4 93 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 MAN1C1Q9NR34 630 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 ARHGAP23Q9P227 1491 aa13.44□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 A0A087X1B8 175 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 BGNP21810 368 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 GLRBP48167 497 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 CEP78Q5JTW2 689 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 YME1L1Q96TA2 773 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 BBS2Q9BXC9 721 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 SNX13Q9Y5W8 968 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 DUSP10Q9Y6W6 482 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 ZNF839A8K0R7 811 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 H3BRB1 525 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 MSH3P20585 1137 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 C4BPBP20851 252 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 PTPN3P26045 913 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 SLC1A6P48664 564 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 CDK7P50613 346 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 WASHC2DQ5SRD0 308 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 ELOVL4Q9GZR5 314 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 STARD7Q9NQZ5 370 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 TMCO1Q9UM00 188 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 TRIM66O15016 1216 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 RAD23AP54725 363 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 OVOS1Q6IE37 1185 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 TAF2Q6P1X5 1199 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 KIAA0895Q8NCT3 520 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 DDHD1Q8NEL9 900 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 FBXO25Q8TCJ0 367 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 HTR3CQ8WXA8 447 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 SNTG2Q9NY99 539 aa13.43□□□□□ -0.26
TNS1-205ENST00000419504 L1RE1Q9UN81 338 aa13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms