RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 LPIN1Q14693 890 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 ANKRD42Q8N9B4 389 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 MZB1Q8WU39 189 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 ULBP1Q9BZM6 244 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 RASSF4Q9H2L5 321 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 ETNK1Q9HBU6 452 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 HHLA1C9JL84 531 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 ZWINTO95229 277 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 MLNP12872 115 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 NRLP54845 237 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 PPARDQ03181 441 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 SPARCL1Q14515 664 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 LRRC14Q15048 493 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 DCAKDQ8WVC6 231 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 CHMP2BQ9UQN3 213 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.88■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 A0A0A0MRY4 1105 aa20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 KBTBD13C9JR72 458 aa20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 MGEA5O60502 916 aa20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 FYNP06241 537 aa20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 NDUFV1P49821 464 aa20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 SARNPP82979 210 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 DPYSQ14117 519 aa20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 PDK1Q15118 436 aa20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 CYS1Q717R9 158 aa20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 MGARPQ8TDB4 240 aa20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 SPATA13Q96N96 652 aa20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF180Q9UJW8 692 aa20.87■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 CAPN9O14815 690 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 OPHN1O60890 802 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 TYMPP19971 482 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 AMPD1P23109 780 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 ADRA1BP35368 520 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 TRIM32Q13049 653 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 SEMA3BQ13214 749 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 PM20D1Q6GTS8 502 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 CAPN12Q6ZSI9 719 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC110Q8TBZ0 833 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 ZIC5Q96T25 663 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 PKMYT1Q99640 499 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM51Q9NW97 253 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 NRP1O14786 923 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 TM9SF1O15321 606 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 NCAM2O15394 837 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 LTFP02788 710 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 APRTP07741 180 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 PRKCHP24723 683 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 WDR4P57081 412 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 NOGQ13253 232 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 ARL13BQ3SXY8 428 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 RNF180Q86T96 592 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 IGDCC3Q8IVU1 814 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 C10orf67Q8IYJ2 551 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 CCT6BQ92526 530 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 PIGVQ9NUD9 493 aa20.86■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.85■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 E7ENQ6 273 aa20.85■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 TRIM66O15016 1216 aa20.85■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 DCLK1O15075 740 aa20.85■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 ITGA7Q13683 1181 aa20.85■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 RFX8Q6ZV50 586 aa20.85■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 ADAM2Q99965 735 aa20.85■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.85■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 IKBKGQ9Y6K9 419 aa20.85■□□□□ 0.93
SUMO3-204ENST00000411651 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms