RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 ZSCAN12O43309 604 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 STC2O76061 302 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 MOCS3O95396 460 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 GBP1P32455 592 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 CXCR3P49682 368 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 TBX4P57082 545 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 OTOP3Q7RTS5 596 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 GOLPH3Q9H4A6 298 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 THEGQ9P2T0 379 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 LEFTY2O00292 366 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 LRCH4O75427 683 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 F9P00740 461 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 IRF1P10914 325 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 VIPR2P41587 438 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 COG7P83436 770 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 KIAA1524Q8TCG1 905 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 SH3RF2Q8TEC5 729 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 LRRC3BQ96PB8 259 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 TRPV4Q9HBA0 871 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 EPS15L1Q9UBC2 864 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa24.5■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 C2CD4DB7Z1M9 353 aa24.49■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 GREM1O60565 184 aa24.49■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 TCF4P15884 667 aa24.49■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 RING1Q06587 406 aa24.49■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 ACAP1Q15027 740 aa24.49■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 FAM131BQ86XD5 332 aa24.49■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 ANLNQ9NQW6 1124 aa24.49■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 CFAP97Q9P2B7 532 aa24.49■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 GRID2IPA4D2P6 1211 aa24.48■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 I6L893 689 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 KLKB1P03952 638 aa24.48■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 USP4Q13107 963 aa24.48■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF77Q15935 545 aa24.48■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 TANGO2Q6ICL3 276 aa24.48■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 LRRC57Q8N9N7 239 aa24.48■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 TTC16Q8NEE8 873 aa24.48■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 PLD4Q96BZ4 506 aa24.48■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 LCMT1Q9UIC8 334 aa24.48■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 HYOU1Q9Y4L1 999 aa24.48■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 RNF8O76064 485 aa24.47■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 TCF3P15923 654 aa24.47■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 MIPP30301 263 aa24.47■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 MAN1A1P33908 653 aa24.47■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 C11orf63Q6NUN7 778 aa24.47■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 PARM1Q6UWI2 310 aa24.47■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 FGF14Q92915 247 aa24.47■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa24.47■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 KCNU1A8MYU2 1149 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 DESP17661 470 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 CCR1P32246 355 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 PCK1P35558 622 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 PPP2R5DQ14738 602 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 DAAM2Q86T65 1068 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC185Q8N715 623 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 RNF34Q969K3 372 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 PEBP4Q96S96 227 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 WDCPQ9H6R7 721 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 KIF9Q9HAQ2 790 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 KCND1Q9NSA2 647 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 FAM50BQ9Y247 325 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 ALG6Q9Y672 507 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 COMTP21964 271 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 SCYL2Q6P3W7 929 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 TKTL2Q9H0I9 626 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 ZFP14Q9HCL3 533 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 PCSK1NQ9UHG2 260 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS1-201ENST00000376215 MYO10Q9HD67 2058 aa24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms