RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR60Q8WVS4 1066 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 RSC1A1Q92681 617 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 MCRS1Q96EZ8 462 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 HS6ST2Q96MM7 605 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 DACT1Q9NYF0 836 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 SEMA5BQ9P283 1151 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 GRHPRQ9UBQ7 328 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 KAT6AQ92794 2004 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 PRRT4C9JH25 899 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 UBE2Q2LH0YL09 131 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 ITGA2BP08514 1039 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 DUSP1P28562 367 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 AKT1P31749 480 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 PNLIPRP1P54315 467 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 POLE2P56282 527 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNB1Q14721 858 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 AWAT1Q58HT5 328 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 ACSM6Q6P461 480 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT27Q7Z3Y8 459 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 TRABD2AQ86V40 505 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 STT3BQ8TCJ2 826 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 DPF1Q92782 380 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 ASB2Q96Q27 587 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 ADGRE3Q9BY15 652 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 MAGEH1Q9H213 219 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 ABHD10Q9NUJ1 306 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC01548A6NM66 108 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 NBNO60934 754 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 RPP40O75818 363 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 PRKCGP05129 697 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP2D6P10635 497 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR5P61964 334 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 GAB1Q13480 694 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM60Q495X7 471 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 LIN54Q6MZP7 749 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 VSTM1Q6UX27 236 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 C16orf89Q6UX73 402 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 PTF1AQ7RTS3 328 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 OR4N4Q8N0Y3 316 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 MYCT1Q8N699 235 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 OR52L2PQ8NGH6 319 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 GLMPQ8WWB7 406 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 NPIPB3Q92617 1050 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 CRAMP1Q96RY5 1269 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 RTKNQ9BST9 563 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 MLXIPQ9HAP2 919 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNK9Q9NPC2 374 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXO28Q9NVF7 368 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 CNTN6Q9UQ52 1028 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM90A18PA6NE21 464 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM90A16PA6NEW6 464 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 WIPF3A6NGB9 483 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 KIF28PB7ZC32 967 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 M0QYT0 321 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 ACTL6BO94805 426 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 LATS1O95835 1130 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM90A15PP0C7V4 464 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM90A14PP0C7W9 464 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 MATN1P21941 496 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 GRK6P43250 576 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 AP2B1P63010 937 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC14A1Q13336 389 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 AAK1Q2M2I8 961 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 BTBD16Q32M84 506 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 TANGO2Q6ICL3 276 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 SULT6B1Q6IMI4 303 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 KLHL17Q6TDP4 642 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 RANBP10Q6VN20 620 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 C8orf58Q8NAV2 365 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 SCAMP5Q8TAC9 235 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 HIC2Q96JB3 615 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-202ENST00000370826 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms