RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368045.3

CD48-201, Transcript of CD48 molecule, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CD48, Length 1,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48-201ENST00000368045 MGAMO43451 1857 aa14.77□□□□□ -0.05
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CD48-201ENST00000368045 STX3Q13277 289 aa14.76□□□□□ -0.05
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CD48-201ENST00000368045 THAP1Q9NVV9 213 aa14.76□□□□□ -0.05
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CD48-201ENST00000368045 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
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CD48-201ENST00000368045 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
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CD48-201ENST00000368045 LRRC8BQ6P9F7 803 aa14.75□□□□□ -0.05
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CD48-201ENST00000368045 HTR3CQ8WXA8 447 aa14.75□□□□□ -0.05
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CD48-201ENST00000368045 UGT1A9O60656 530 aa14.75□□□□□ -0.05
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CD48-201ENST00000368045 RCN1Q15293 331 aa14.75□□□□□ -0.05
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CD48-201ENST00000368045 MROH9Q5TGP6 573 aa14.75□□□□□ -0.05
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CD48-201ENST00000368045 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
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CD48-201ENST00000368045 ZNF333Q96JL9 665 aa14.75□□□□□ -0.05
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CD48-201ENST00000368045 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa14.74□□□□□ -0.05
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CD48-201ENST00000368045 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.74□□□□□ -0.05
CD48-201ENST00000368045 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CD48-201ENST00000368045 ACSBG2Q5FVE4 666 aa14.74□□□□□ -0.05
CD48-201ENST00000368045 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CD48-201ENST00000368045 MPP5Q8N3R9 675 aa14.74□□□□□ -0.05
CD48-201ENST00000368045 ATP2A3Q93084 1043 aa14.74□□□□□ -0.05
CD48-201ENST00000368045 B3GNT5Q9BYG0 378 aa14.74□□□□□ -0.05
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