RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 PSMG1O95456 288 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 STIP1P31948 543 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 DEUP1Q05D60 604 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC14Q49A88 953 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 MFN1Q8IWA4 741 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 E2F7Q96AV8 911 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 NSL1Q96IY1 281 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 B4GALT4O60513 344 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 DCAF6Q58WW2 860 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 OSMRQ99650 979 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 PAK5Q9P286 719 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa20.54■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 ZBTB42B2RXF5 422 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 CSH1P0DML2 217 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 CSH2P0DML3 217 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 ILDR2Q71H61 639 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 APOPT1Q96IL0 206 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 BTBD10Q9BSF8 475 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 ETNK2Q9NVF9 386 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 TAS2R1Q9NYW7 299 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 ACADSP16219 412 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 SLC34A1Q06495 639 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 NOMO1Q15155 1222 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 C1orf146Q5VVC0 180 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 KDELC2Q7Z4H8 507 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 SMYD2Q9NRG4 433 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 UBP1Q9NZI7 540 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 TGFB3P10600 412 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 C12orf42Q96LP6 360 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.53■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 ATP6V1G1O75348 118 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 PGGT1BP53609 377 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 TDRPQ86YL5 185 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 DNAAF3Q8N9W5 541 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 FZD8Q9H461 694 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 IL18RAPO95256 599 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 GOT1P17174 413 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 MLH1P40692 756 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 PEX6Q13608 980 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 WASHC2DQ5SRD0 308 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 DPP9Q86TI2 863 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 CRLF3Q8IUI8 442 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 UBR7Q8N806 425 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 PYDC1Q8WXC3 89 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 INPP5DQ92835 1189 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 PGBD4Q96DM1 585 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 MED10Q9BTT4 135 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.52■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 C2CD4BA6NLJ0 364 aa20.52■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 ATP9BO43861 1147 aa20.52■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 KRT38O76015 456 aa20.52■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 LGALS2P05162 132 aa20.52■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.52■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.52■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 OR52E8Q6IFG1 317 aa20.52■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 TTC30AQ86WT1 665 aa20.52■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 RNF169Q8NCN4 708 aa20.52■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.52■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 MOCOSQ96EN8 888 aa20.52■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 C2CD2LO14523 706 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 ZMPSTE24O75844 475 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 ACVR2BQ13705 512 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 IRGCQ6NXR0 463 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 UNC5AQ6ZN44 842 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 RELL1Q8IUW5 271 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 AP4E1Q9UPM8 1137 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 CITO14578 2027 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 ARMCX2Q7L311 632 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 EBF4Q9BQW3 602 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 LHX5Q9H2C1 402 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 KANSL3Q9P2N6 904 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.51■□□□□ 0.87
SPNS2-201ENST00000329078 CLDN5O00501 218 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms