RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.5■■□□□ 1.19
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SPHK1-201ENST00000323374 LRRC39Q96DD0 335 aa22.5■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 CFAP36Q96G28 342 aa22.5■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 PCED1BQ96HM7 432 aa22.5■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 OLFM3Q96PB7 478 aa22.5■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 PLCD4Q9BRC7 762 aa22.5■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
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SPHK1-201ENST00000323374 HHATQ5VTY9 493 aa22.49■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 RGS9BPQ6ZS82 235 aa22.49■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 PACS2Q86VP3 889 aa22.49■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC33Q8N5R6 958 aa22.49■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 RNF139Q8WU17 664 aa22.49■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 HTR3CQ8WXA8 447 aa22.49■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 SMOQ99835 787 aa22.49■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 PITPNM3Q9BZ71 974 aa22.49■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 ULBP1Q9BZM6 244 aa22.49■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa22.49■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.49■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.49■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 CAPN9O14815 690 aa22.49■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 INHBAP08476 426 aa22.49■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 THPOP40225 353 aa22.49■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 FLT3LGP49771 235 aa22.49■■□□□ 1.19
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SPHK1-201ENST00000323374 PDK4Q16654 411 aa22.49■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.49■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 CNGB3Q9NQW8 809 aa22.49■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa22.49■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 TM4SF4P48230 202 aa22.48■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 DAOAP59103 153 aa22.48■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 UPP1Q16831 310 aa22.48■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.48■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 PADI3Q9ULW8 664 aa22.48■■□□□ 1.19
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SPHK1-201ENST00000323374 ADAMTS4O75173 837 aa22.48■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 MT-ND3P03897 115 aa22.48■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 PCSK1P29120 753 aa22.48■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 RAB27AP51159 221 aa22.48■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 SEMA5AQ13591 1074 aa22.48■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 PIGVQ9NUD9 493 aa22.48■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 MFSD11O43934 449 aa22.47■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF623O75123 536 aa22.47■■□□□ 1.19
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SPHK1-201ENST00000323374 GSTA2P09210 222 aa22.47■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 CD52P31358 61 aa22.47■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 MAGEA3P43357 314 aa22.47■■□□□ 1.19
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SPHK1-201ENST00000323374 RAB41Q5JT25 222 aa22.47■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 CGB2Q6NT52 195 aa22.47■■□□□ 1.19
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SPHK1-201ENST00000323374 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.47■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 LRRC8CQ8TDW0 803 aa22.47■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 KCNK16Q96T55 309 aa22.47■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 SLC9A7Q96T83 725 aa22.47■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa22.47■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.47■■□□□ 1.19
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SPHK1-201ENST00000323374 E7ENQ6 273 aa22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 TM9SF1O15321 606 aa22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 CREB3O43889 395 aa22.46■■□□□ 1.19
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SPHK1-201ENST00000323374 VAV1P15498 845 aa22.46■■□□□ 1.19
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SPHK1-201ENST00000323374 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 SLC26A11Q86WA9 606 aa22.46■■□□□ 1.19
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SPHK1-201ENST00000323374 SPATA13Q96N96 652 aa22.46■■□□□ 1.19
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SPHK1-201ENST00000323374 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 ABCF3Q9NUQ8 709 aa22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 C9IYK1 514 aa22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 STK10O94804 968 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 ODC1P11926 461 aa22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 FDFT1P37268 417 aa22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 SARNPP82979 210 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 TRIM32Q13049 653 aa22.46■■□□□ 1.19
SPHK1-201ENST00000323374 DNAJC3Q13217 504 aa22.46■■□□□ 1.19
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