RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 EDEM1Q92611 657 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 ETNK2Q9NVF9 386 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 FBXW11Q9UKB1 542 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 LRFN2Q9ULH4 789 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 GOLGA8MH3BSY2 632 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP27.78■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM63AO94886 807 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 OR4Q2P0C623 313 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 SLC39A12Q504Y0 691 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 LEKR1Q6ZMV7 388 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 DTLQ9NZJ0 730 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 IVLP07476 585 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 STAT4Q14765 748 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 TCTN1Q2MV58 587 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 OLFM3Q96PB7 478 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 ADAM28Q9UKQ2 775 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 HOXA2O43364 376 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 GRIK1P39086 918 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 MDH1P40925 334 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 SLC5A3P53794 718 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 GAD2Q05329 585 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 ZBED8Q8IZ13 594 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC77Q9BR77 488 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXD8-201ENST00000313173 TET1Q8NFU7 2136 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 TTC3P53804 2025 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 E7ESA3 106 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 GATMP50440 423 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 DPYSQ14117 519 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 KCNJ11Q14654 390 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 ARL13BQ3SXY8 428 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 KCNT2Q6UVM3 1135 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 C4orf22Q6V702 233 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 SCAMP5Q8TAC9 235 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 ARMC5Q96C12 935 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 COLEC11Q9BWP8 271 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 VWA8A3KMH1 1905 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 HACD1B0YJ81 288 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 TNFRSF10BO14763 440 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 CHADO15335 359 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 CREB3O43889 395 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 DGKIO75912 1065 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 CXCR3P49682 368 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 SEMA3BQ13214 749 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 RFX8Q6ZV50 586 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 NPAS4Q8IUM7 802 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 ANLNQ9NQW6 1124 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 SCN5AQ14524 2016 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 ERICH4A6NGS2 130 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 MFSD11O43934 449 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 GUCY1A3Q02108 690 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 FNBP1LQ5T0N5 605 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 TAC4Q86UU9 113 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 CRIPAKQ8N1N5 446 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 CXCL10P02778 98 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC13Q8IYE1 715 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 HIPK3Q9H422 1215 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 RAB6BQ9NRW1 208 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 MARCH5Q9NX47 278 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 I6L893 689 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 GCATO75600 419 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 PDIK1LQ8N165 341 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 SCLYQ96I15 445 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 KLC2Q9H0B6 622 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 DCLK1O15075 740 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 PARNO95453 639 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
HOXD8-201ENST00000313173 MAGEA6P43360 314 aa27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms