RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304623.12

CTNND2-201, Transcript of catenin delta 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTNND2, Length 5,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2-201ENST00000304623 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 GGA3Q9NZ52 723 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 TPRKBQ9Y3C4 175 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 FAM220BPB1ANY3 271 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 ASNA1O43681 348 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 ZBTB7AO95365 584 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 FAM153BP0C7A2 387 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 FAM153CQ494X1 144 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 SDE2Q6IQ49 451 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 APOL4Q9BPW4 351 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 RERGLQ9H628 205 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 UBXN8O00124 270 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 GSTM1P09488 218 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 NPY2RP49146 381 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 PDIA6Q15084 440 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 C9orf16Q9BUW7 83 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 CNGB3Q9NQW8 809 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 DSEQ9UL01 958 aa20.37■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 ATG7O95352 703 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 RNFT2Q96EX2 444 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 SEPHS2Q99611 448 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 ACTR8Q9H981 624 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 VPS4BO75351 444 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 UPP2O95045 317 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 RAP1GAPP47736 663 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 LHX1P48742 406 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 NTRK3Q16288 839 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 RORBQ92753 470 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 TRIM63Q969Q1 353 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 UGT2B28Q9BY64 529 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 PARVBQ9HBI1 364 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 POLE3Q9NRF9 147 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 MRASO14807 208 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 RARAP10276 462 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 CYP2B6P20813 491 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 TMEM237Q96Q45 408 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 CEP44Q9C0F1 390 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 CENPXA8MT69 81 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 FAM25AB3EWG3 89 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 FAM25CB3EWG5 89 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 FAM25GB3EWG6 89 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 SLC2A4P14672 509 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 DPP10Q8N608 796 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 GMCL1Q96IK5 515 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 DUSP12Q9UNI6 340 aa20.36■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 A0A087WXM4 84 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 B3GAT3O94766 335 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 PIK3R1P27986 724 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 PRKCQQ04759 706 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 ATP1A4Q13733 1029 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 ZNF544Q6NX49 715 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 MIB1Q86YT6 1006 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 PGBD3Q8N328 593 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 CENPTQ96BT3 561 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 GINS4Q9BRT9 223 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 INPP4BO15327 924 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 NR2C2P49116 596 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 DGUOKQ16854 277 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 ZNF284Q2VY69 593 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 CCDC149Q6ZUS6 474 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 FIG4Q92562 907 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 NT5MQ9NPB1 228 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 TBC1D12O60347 775 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 SLC9A5Q14940 896 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 KCNMB4Q86W47 210 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 NMRAL1Q9HBL8 299 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 RRN3Q9NYV6 651 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 GPR182O15218 404 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 HALP42357 657 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 TRIQKQ629K1 86 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 ARPINQ7Z6K5 226 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 FUKQ8N0W3 1084 aa20.35■□□□□ 0.85
CTNND2-201ENST00000304623 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms