RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 ARRB2P32121 409 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 MAGEA6P43360 314 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 C6orf163Q5TEZ5 329 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 ILDR2Q71H61 639 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 HPDLQ96IR7 371 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 CPB2Q96IY4 423 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 THAP1Q9NVV9 213 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 BTBD7Q9P203 1132 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF112Q9UJU3 913 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 WDR27A2RRH5 827 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 F7P08709 466 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 CYP2F1P24903 491 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 EPHB1P54762 984 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 WASHC5Q12768 1159 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 TREML2Q5T2D2 321 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 DCAF15Q66K64 600 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 DPY19L2Q6NUT2 758 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 JDP2Q8WYK2 163 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 FGD4Q96M96 766 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 LPIN3Q9BQK8 851 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 EBF3Q9H4W6 596 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 HOXC10Q9NYD6 342 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 SOX13Q9UN79 622 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 PSAT1Q9Y617 370 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 EVPLQ92817 2033 aa17.88■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 BUD23O43709 281 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 HDAC4P56524 1084 aa17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 SARNPP82979 210 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 PDK2Q15119 407 aa17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 CASC4Q6P4E1 433 aa17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 OLFML1Q6UWY5 402 aa17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 MIS12Q9H081 205 aa17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 C2orf40Q9H1Z8 148 aa17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 CYP4F11Q9HBI6 524 aa17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 FAM49BQ9NUQ9 324 aa17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 TPP1O14773 563 aa17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 GSTA2P09210 222 aa17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 RABGAP1LQ5R372 815 aa17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 HIPK4Q8NE63 616 aa17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 GPR20Q99678 358 aa17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 PNPOQ9NVS9 261 aa17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 GJA3Q9Y6H8 435 aa17.87■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 C19orf81C9J6K1 198 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 BIRC5O15392 142 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 GABBR2O75899 941 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 IL18RAPO95256 599 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 AOC1P19801 751 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 RAB27AP51159 221 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 IGBP1P78318 339 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 BOLA3Q53S33 107 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 LPCAT4Q643R3 524 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 EFCAB12Q6NXP0 572 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 KCNT2Q6UVM3 1135 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 TTC30AQ86WT1 665 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 MCUQ8NE86 351 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 CLEC4CQ8WTT0 213 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 COPS5Q92905 334 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 CEP41Q9BYV8 373 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 STK32BQ9NY57 414 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 ADCY6O43306 1168 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 ZMPSTE24O75844 475 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 EDNRBP24530 442 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 CRABP2P29373 138 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 SDC4P31431 198 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 SLC1A6P48664 564 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 CBLBQ13191 982 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 HIC1Q14526 733 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 SLC10A6Q3KNW5 377 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 PPM1JQ5JR12 505 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 AP1ARQ63HQ0 302 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 LCLAT1Q6UWP7 414 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 NCAPG2Q86XI2 1143 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 FAM167AQ96KS9 214 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 MOCS1Q9NZB8 636 aa17.86■□□□□ 0.45
PDE4A-201ENST00000293683 TNFSF13BQ9Y275 285 aa17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms