RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 PBX3P40426 434 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 DPYSL3Q14195 570 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 SOWAHAQ2M3V2 549 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 CST9Q5W186 159 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 FAM136AQ96C01 138 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 KCNK16Q96T55 309 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 PAFAH2Q99487 392 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 NPHS2Q9NP85 383 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 OR12D3Q9UGF7 316 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 E5RI56 91 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 GPC4O75487 556 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 TTC4O95801 387 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 EDN1P05305 212 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 IQCF3P0C7M6 154 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 SELPP16109 830 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 IRAK1P51617 712 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 USP10Q14694 798 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 LMO3Q8TAP4 145 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 ERLEC1Q96DZ1 483 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 MAGEB5Q9BZ81 275 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 SDCBP2Q9H190 292 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 HACD3Q9P035 362 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 PHIPQ8WWQ0 1821 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 MMEL1Q495T6 779 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 TTMPQ5BVD1 217 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 DCAF12L1Q5VU92 463 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 RASGEF1CQ8N431 466 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 SERPINB12Q96P63 405 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 SGIP1Q9BQI5 828 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 FBXO44Q9H4M3 255 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 PCYOX1Q9UHG3 505 aa10.66□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 CASP2P42575 452 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 EPHB3P54753 998 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 TUSC3Q13454 348 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 ALLCQ8N6M5 410 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 KLHL29Q96CT2 875 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 PCDHGC3Q9UN70 934 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 CBX4O00257 560 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 TULP2O00295 520 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 TRIM66O15016 1216 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 FANCGO15287 622 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 SOAT2O75908 522 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 MGAT1P26572 445 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 ACAP1Q15027 740 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 TTC27Q6P3X3 843 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 TRIM67Q6ZTA4 783 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 SLAIN1Q8ND83 568 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 PCED1BQ96HM7 432 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 RNF157Q96PX1 679 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 TTC1Q99614 292 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 MYBPHLA2RUH7 354 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 ATXN8OSP0DMR3 200 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 FRA10AC1Q70Z53 315 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 LGMNQ99538 433 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 FOXP3Q9BZS1 431 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 SLC39A10Q9ULF5 831 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 GOLGA8TH3BQL2 631 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 NEMP1O14524 444 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 WEE1P30291 646 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 UNC45BQ8IWX7 931 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 LGI2Q8N0V4 545 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 PYROXD2Q8N2H3 581 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 KAT2BQ92831 832 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 HSFY1Q96LI6 401 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 NEUROG2Q9H2A3 272 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 ABCC13Q9NSE7 274 aa10.65□□□□□ -0.7
TTPAL-201ENST00000262605 MDM4O15151 490 aa10.65□□□□□ -0.71
TTPAL-201ENST00000262605 DIAPH2O60879 1101 aa10.65□□□□□ -0.71
TTPAL-201ENST00000262605 LRCH4O75427 683 aa10.65□□□□□ -0.71
TTPAL-201ENST00000262605 KLRC2P26717 231 aa10.65□□□□□ -0.71
TTPAL-201ENST00000262605 FAM111AQ96PZ2 611 aa10.65□□□□□ -0.71
TTPAL-201ENST00000262605 FTHL17Q9BXU8 183 aa10.65□□□□□ -0.71
TTPAL-201ENST00000262605 LRRC19Q9H756 370 aa10.65□□□□□ -0.71
TTPAL-201ENST00000262605 SIX4Q9UIU6 781 aa10.65□□□□□ -0.71
TTPAL-201ENST00000262605 ZFP69BQ9UJL9 534 aa10.65□□□□□ -0.71
TTPAL-201ENST00000262605 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
TTPAL-201ENST00000262605 AVILO75366 819 aa10.64□□□□□ -0.71
TTPAL-201ENST00000262605 SYF2O95926 243 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TTPAL-201ENST00000262605 TAC1P20366 129 aa10.64□□□□□ -0.71
TTPAL-201ENST00000262605 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms