RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 SLC26A11Q86WA9 606 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 FAF2Q96CS3 445 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM175Q9BSA9 504 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SIX4Q9UIU6 781 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 BRAFP15056 766 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SELPP16109 830 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 RBBP7Q16576 425 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 KIF19Q2TAC6 998 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 UNC45BQ8IWX7 931 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF516Q92618 1163 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 LGALS13Q9UHV8 139 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 CHD4Q14839 1912 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 DCTN3O75935 186 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 CTSHP09668 335 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 DNAJB1P25685 340 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 NPY2RP49146 381 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 C1orf54Q8WWF1 131 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 NCLNQ969V3 563 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 DRC3Q9H069 523 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SALL4Q9UJQ4 1053 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC189A1A4V9 331 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 FAM47DPA6NHR8 397 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 DDHD2O94830 711 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SYF2O95926 243 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 L1CAMP32004 1257 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 IRAK1P51617 712 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 MON1AQ86VX9 555 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ZBTB18Q99592 522 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 HEMGNQ9BXL5 484 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TEX12Q9BXU0 123 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 EPN3Q9H201 632 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 MICAL2O94851 1124 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ADORA2BP29275 332 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 LILRA4P59901 499 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 RAD51Q06609 339 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 NME3Q13232 169 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 RCN2Q14257 317 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 MFSD4BQ5TF39 518 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 FAM35AQ86V20 835 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TRIM51Q9BSJ1 452 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PITPNM1O00562 1244 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 CCR1P32246 355 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 DPYSL2Q16555 572 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SYTL3Q4VX76 610 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SLC45A4Q5BKX6 768 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 XYLT1Q86Y38 959 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SPON2Q9BUD6 331 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TAS2R14Q9NYV8 317 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 F5H423 210 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TM9SF1O15321 606 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TIMM44O43615 452 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 MYL4P12829 197 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TNFSF9P41273 254 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SLC7A5Q01650 507 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SCAPQ12770 1279 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TBC1D19Q8N5T2 526 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 GOLPH3Q9H4A6 298 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 COG5Q9UP83 839 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PFKMP08237 780 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SPRP35270 261 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ITGA7Q13683 1181 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ADCK2Q7Z695 626 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 GPR88Q9GZN0 384 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 LRRC40Q9H9A6 602 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.051e-7■■■□□ 14.9
PTPN3-201ENST00000262539 SELENONQ9NZV5 590 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 HOXC8P31273 242 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 POLD2P49005 469 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PARP6Q2NL67 630 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms