RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 CD300LGQ6UXG3 332 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 BEND5Q7L4P6 421 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 VPS52Q8N1B4 723 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 MYLPFQ96A32 169 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 SUSD3Q96L08 255 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 GLT1D1Q96MS3 346 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 FERMT1Q9BQL6 677 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 KCNK9Q9NPC2 374 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 ARHGEF4Q9NR80 690 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 RGS18Q9NS28 235 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 RAD54BQ9Y620 910 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 NRP1O14786 923 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 LTFP02788 710 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 FYNP06241 537 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 HCAR3P49019 387 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 SYPL2Q5VXT5 272 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 ADGRD1Q6QNK2 874 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 THEM5Q8N1Q8 247 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 RNF169Q8NCN4 708 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 DYDC1Q8WWB3 177 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 RSPH1Q8WYR4 309 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 PKMYT1Q99640 499 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 HTTP42858 3142 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 GSTA2P09210 222 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 CREB1P16220 341 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 AMPD1P23109 780 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 NRLP54845 237 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 PM20D1Q6GTS8 502 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 C6orf89Q6UWU4 347 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 SEC16BQ96JE7 1060 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 CYTH2Q99418 400 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 FAM47DPA6NHR8 397 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 YJEFN3A6XGL0 299 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 E7ENQ6 273 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 BANF1O75531 89 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 SSTR1P30872 391 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 ADRA1BP35368 520 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 QPCTQ16769 361 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 HFE2Q6ZVN8 426 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 FBF1Q8TES7 1133 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 CKAP2Q8WWK9 683 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 KCNK16Q96T55 309 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 ETNK1Q9HBU6 452 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 PIGVQ9NUD9 493 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 KIAA0754O94854 1291 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 CKBP12277 381 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 FDFT1P37268 417 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 ELK3P41970 407 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 CDK16Q00536 496 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 DPYSQ14117 519 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 PDK1Q15118 436 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 ARL13BQ3SXY8 428 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 PYROXD2Q8N2H3 581 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 SLC43A3Q8NBI5 491 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 SLC7A14Q8TBB6 771 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 HTR3CQ8WXA8 447 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 STK10O94804 968 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 KRT15P19012 456 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 GLUD2P49448 558 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 PPARDQ03181 441 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 SEMA5AQ13591 1074 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 CCDC110Q8TBZ0 833 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 SMC6Q96SB8 1091 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 TRABDQ9H4I3 376 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 FBXW11Q9UKB1 542 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 A0A0A0MRY4 1105 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 MYO1CO00159 1063 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 STX2P32856 288 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 MAGEA3P43357 314 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 BRCC3P46736 316 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 CACNA2D1P54289 1103 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 TSPY1Q01534 308 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 SEMA3BQ13214 749 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 NME3Q13232 169 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 OVOS1Q6IE37 1185 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 GLB1LQ6UWU2 654 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 CAPN12Q6ZSI9 719 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 RFX8Q6ZV50 586 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 SLC24A5Q71RS6 500 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXD9-201ENST00000249499 BHLHA9Q7RTU4 235 aa23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms