RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC185Q8N715 623 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 RSAD2Q8WXG1 361 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 HAUS1Q96CS2 278 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 SCLYQ96I15 445 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 CSPG4P5Q96PW8 444 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM118BQ9BPY3 351 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 ADAM7Q9H2U9 754 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 AAASQ9NRG9 546 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 COMMD8Q9NX08 183 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 IL37Q9NZH6 218 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 FBXW11Q9UKB1 542 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 HTTP42858 3142 aa9.9□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 CARNS1A5YM72 827 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 HACD1B0YJ81 288 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SGK1O00141 431 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TRIM66O15016 1216 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 IGLV3-25P01717 112 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CYP2C18P33260 490 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ADRA1BP35368 520 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ARL4AP40617 200 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CXCR3P49682 368 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC5A3P53794 718 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CCL23P55773 120 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 GPS1Q13098 491 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 IKBKEQ14164 716 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 P3H1Q32P28 736 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ARL13BQ3SXY8 428 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CTXN3Q4LDR2 81 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 EFHC2Q5JST6 749 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM171A1Q5VUB5 890 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 BSPRYQ5W0U4 402 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 DENND2CQ68D51 928 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 C4orf22Q6V702 233 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ANKS3Q6ZW76 656 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM131BQ86XD5 332 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CEP295NLQ96MC4 621 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM121Q9BTD3 319 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 USP29Q9HBJ7 922 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TMBIM4Q9HC24 238 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 PIGVQ9NUD9 493 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 PSD3Q9NYI0 1048 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.89□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM92AA1XBS5 289 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 GOLGA6L10A6NI86 522 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TBKBP1A7MCY6 615 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 RIPK2O43353 540 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 EFCAB14O75071 495 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 DGKIO75912 1065 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 MYCP01106 439 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CLTBP09497 229 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 MYZAPP0CAP1 466 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 NCAM1P13591 858 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 RPL22P35268 128 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CHKAP35790 457 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 GRIK1P39086 918 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 MAGEA6P43360 314 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 GATMP50440 423 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF844Q08AG5 666 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SEMA3BQ13214 749 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 GPR17Q13304 367 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC39A12Q504Y0 691 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 TTMPQ5BVD1 217 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 BRMS1LQ5PSV4 323 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 AGBL2Q5U5Z8 902 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 MON1AQ86VX9 555 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 PPIL6Q8IXY8 311 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 ARHGAP18Q8N392 663 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 GLIS1Q8NBF1 620 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC7A14Q8TBB6 771 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 SPPL2BQ8TCT7 592 aa9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
APOBEC1-201ENST00000229304 RNF139Q8WU17 664 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms