RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 PPM1HQ9ULR3 514 aa22.88■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 PIK3R2O00459 728 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 GRAP2O75791 330 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 TOMM70O94826 608 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 L1CAMP32004 1257 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 NLRP4Q96MN2 994 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF778Q96MU6 729 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 STEAP4Q687X5 459 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM172AQ8WUF8 416 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR20Q99678 358 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 EMCNQ9ULC0 261 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 ALDH1A2O94788 518 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 KLHL2O95198 593 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 MAP3K6O95382 1288 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 STAG3L1P0CL83 205 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 NDST1P52848 882 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 SARNPP82979 210 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 CDC16Q13042 620 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 LY6KQ17RY6 165 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 OLFML1Q6UWY5 402 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 JDP2Q8WYK2 163 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 HPDLQ96IR7 371 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC1Q99614 292 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 GJB1P08034 283 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 SEMA5AQ13591 1074 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 HIC1Q14526 733 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 DPH6Q7L8W6 267 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM50Q86XT4 487 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 FGD4Q96M96 766 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 ASB7Q9H672 318 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 S100A14Q9HCY8 104 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 AP1ARQ63HQ0 302 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 APOL6Q9BWW8 343 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 FZD1Q9UP38 647 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 ITM2AO43736 263 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 SDC4P31431 198 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 EFHC1Q5JVL4 640 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 SESTD1Q86VW0 696 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC39CQ8N584 583 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRN4Q8WUT4 740 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 AFG1LQ8WV93 481 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 GLRA3O75311 464 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 BAG2O95816 211 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 IQCF3P0C7M6 154 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP2F1P24903 491 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 INHBEP58166 350 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 STILQ15468 1287 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 CCNJLQ8IV13 435 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 MICALL2Q8IY33 904 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 MCF2P10911 925 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 GRIA1P42261 906 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC1A6P48664 564 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 PDE1BQ01064 536 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 NIPAL4Q0D2K0 466 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 GBP5Q96PP8 586 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 NR2C2P49116 596 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC6A3Q01959 620 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 TNFAIP2Q03169 654 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 PGM2L1Q6PCE3 622 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 LBX2Q6XYB7 198 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC4A5Q9BY07 1137 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM96AQ9H5X1 160 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-201ENST00000218364 MEI4A8MW99 385 aa22.83■■□□□ 1.25
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