RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnali1Q8BVN8 258 aa13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kctd15Q8K0E1 283 aa13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pip4k2cQ91XU3 421 aa13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cog2Q921L5 731 aa13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SncaipQ99ME3 962 aa13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrc57Q9D1G5 239 aa13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dgcr8Q9EQM6 773 aa13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyb561d2Q9WUE3 222 aa13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp212G3X8R7 492 aa13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AvilO88398 819 aa13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pou4f1P17208 421 aa13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tgm2P21981 686 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Elk3P41971 409 aa13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prdx5P99029 210 aa13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rcsd1Q3UZA1 412 aa13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Syt15Q8C6N3 418 aa13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Haus3Q8QZX2 570 aa13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stx19Q8R1Q0 292 aa13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndufs1Q91VD9 727 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4921530L21RikQ9CQ47 274 aa13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ptgdr2Q9Z2J6 382 aa13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Col3a1P08121 1464 aa13.19□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ScinQ60604 715 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpsm1Q6IR34 673 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr348Q8VGK3 313 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ophn1Q99J31 802 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndufaf1Q9CWX2 328 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4933428M09RikQ9D3X3 192 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgef10Q8C033 1345 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp985A2A7A5 519 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1023A2ASU6 311 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kctd18E0CZ26 429 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Has3O08650 554 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc27a2O35488 620 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HdxQ14B70 692 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam83fQ3UKU4 495 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smg5Q6ZPY2 1017 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 B3glctQ8BHT6 489 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klhl28Q9CR40 571 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AatfQ9JKX4 526 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serpina3cP29621 417 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arl5cQ6P068 179 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem82Q8R115 356 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MutyhQ99P21 515 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CoprsQ9CQ13 173 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc12a4Q9JIS8 1085 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pck1Q9Z2V4 622 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lzts3A2AHG0 700 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Foxn2E9Q7L6 429 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PorP37040 678 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ephb3P54754 993 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 VegfaQ00731 214 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spout1Q3UHX9 385 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arnt2Q61324 712 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 E2f7Q6S7F2 904 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp6nlQ80XC3 819 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ugt3a2Q8JZZ0 523 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ero1aQ8R180 464 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr345Q8VGK4 311 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc14a1Q8VHL0 384 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gemin2Q9CQQ4 269 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serbp1Q9CY58 407 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Duoxa2Q9D311 320 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myo1cQ9WTI7 1063 aa13.18□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zscan5bB2RTN3 468 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ces1bD3Z5G7 567 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10250G3X9L6 160 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Akr1b10G5E895 316 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Drg1P32233 367 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hspa4lP48722 838 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc138Q0VF22 680 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bpifb5Q3UQ05 490 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snx16Q8C080 344 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp27Q8CEG8 438 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kdm1bQ8CIG3 826 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Itm2cQ91VK4 269 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DeraQ91YP3 318 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Unc45aQ99KD5 944 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nme5Q99MH5 211 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp5hQ9DCX2 161 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm28360A0A087WR25 190 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1305A2AVW3 312 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp558E9Q1J0 407 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Casq2O09161 415 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dhx15O35286 795 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hsd17b7O88736 334 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sstr1P30873 391 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Htr2cP34968 459 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LmnaP48678 665 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Epb41l5Q8BGS1 731 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ldhal6bQ8BVP2 382 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fbxl5Q8C2S5 690 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrpl58Q8R035 206 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr385Q8VGT1 312 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clca1Q9D7Z6 913 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tex9Q9D845 387 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CrotQ9DC50 612 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 0610012G03RikA0A0J9YTR2 95 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp780bE9Q2S6 806 aa13.17□□□□□ -0.3
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Oas1fQ14AZ4 364 aa13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.7 ms