RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026474.4

Gli1-201, Transcript of Zinc finger protein GLI1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gli1, Length 4,057 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1-201ENSMUST00000026474 Pcdhgb1Q91XX8 918 aa14.94□□□□□ -0.02
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Gli1-201ENSMUST00000026474 Wdr54Q9R0D8 334 aa14.92□□□□□ -0.02
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Gli1-201ENSMUST00000026474 Myadml2Q08AU7 307 aa14.91□□□□□ -0.02
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