RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klhl41A2AUC9 606 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 5830411N06RikB3F5L4 1112 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acot1O55137 419 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Usp2O88623 613 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cnr2P47936 347 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RalaP63321 206 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fgf14P70379 247 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp217Q3U0X6 1041 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tstd2Q3U269 495 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q6PD19 689 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sval3Q76I99 144 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kiaa0895Q7TQE7 519 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 LarsQ8BMJ2 1178 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Afap1l1Q8BZI0 768 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ldlrap1Q8C142 308 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc24a5Q8C261 501 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Uba3Q8C878 462 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam149aQ8CFV2 787 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Oas1dQ8VI95 361 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lztr1Q9CQ33 837 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Thap2Q9D305 217 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Coro1bQ9WUM3 484 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mtm1Q9Z2C5 603 aa11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MylkQ6PDN3 1941 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm28729A0A1B0GSW2 409 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam83cA2ARK0 776 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adam34A2RSG8 714 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trim30cD3YVI9 513 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 D3Z070 196 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5624F6ZZG8 207 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r176G3UW31 304 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnfrsf18O35714 228 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bnc1O35914 961 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ZfrO88532 1074 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fgd3O88842 733 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pla2g4bP0C871 782 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hoxb4P10284 250 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HdcP23738 662 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pik3caP42337 1068 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lefty2P57785 368 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrps6P58064 125 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcmtd1P59913 357 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 YwhagP61982 247 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hmgb1P63158 215 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Togaram2Q3TYG6 1002 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Naf1Q3UMQ8 489 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mtnr1aQ61184 353 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tpgs2Q66JT5 296 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mettl20Q80ZM3 255 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmco3Q8BH01 678 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Taf15Q8BQ46 557 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Elp2Q91WG4 831 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serbp1Q9CY58 407 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cacng3Q9JJV5 315 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc26a3Q9WVC8 757 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tep1P97499 2629 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm36028A0A0U1RPM1 299 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem245B1AZA5 876 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NuggcD3YWJ0 796 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm20403G3UYB0 123 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Grip2G3XA20 1042 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A630095N17RikJ3KMM7 116 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bub1O08901 1058 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hoxa9P09631 271 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 LcatP16301 438 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc11a1P41251 548 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sipa1P46062 1037 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PkmP52480 531 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fermt1P59113 677 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ect2Q07139 913 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zbtb48Q1H9T6 681 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nfe2l2Q60795 597 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr855Q7TRF8 312 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Frmd4aQ8BIE6 1020 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ints6lQ8BND4 861 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbxo48Q8CAT8 161 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Golph3lQ8R088 285 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adgrf1Q8VEC3 908 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mark1Q8VHJ5 795 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem168Q91VX9 697 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Creld1Q91XD7 420 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cts3Q91ZD5 332 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Med4Q9CQA5 270 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CatsperzQ9CQP8 194 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rrp8Q9DB85 457 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gtf2h1Q9DBA9 547 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tcirg1Q9JHF5 834 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf14Q9JI90 485 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rad1Q9QWZ1 280 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nfs1Q9Z1J3 459 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scn8aQ9WTU3 1978 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm13283A0A087WPG5 182 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp990B1AVN5 605 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zbtb11G5E8B9 1050 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5814J3QP80 125 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mmp15O54732 657 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Coro1aO89053 461 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PrkchP23298 683 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.6 ms