RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Baiap2l2Q80Y61 522 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rcn2Q8BP92 320 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ankrd52Q8BTI7 1076 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr356Q8VFP5 315 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Itm2cQ91VK4 269 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ptdss1Q99LH2 473 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Grk2Q99MK8 689 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trpm5Q9JJH7 1158 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ank3G5E8K5 1961 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgap42B2RQE8 841 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 JchainP01592 159 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NrlP54846 237 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmprss15P97435 1069 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Suz12Q80U70 741 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hspbap1Q8BK58 483 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pyhin1Q8BV49 420 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ace2Q8R0I0 805 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 GldcQ91W43 1025 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nme5Q99MH5 211 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AadacQ99PG0 398 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mrps17Q9CQE3 120 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Polr3eQ9CZT4 710 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tekt1Q9DAJ2 418 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Actl7bQ9QY83 418 aa27.06■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 B020011L13RikA0A087WQI7 412 aa27.05■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ces1bD3Z5G7 567 aa27.05■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfr1354E9Q5G9 310 aa27.05■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PtproE9Q612 1226 aa27.05■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Il1rapl1P59823 695 aa27.05■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Esyt3Q5DTI8 891 aa27.05■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AcdQ5EE38 416 aa27.05■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pglyrp2Q8VCS0 530 aa27.05■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bzw1Q9CQC6 419 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ralgapa2A3KGS3 1872 aa27.05■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vmn2r103E9PWW0 856 aa27.05■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atoh1P48985 351 aa27.05■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 G3bp2P97379 482 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc36a1Q8K4D3 475 aa27.05■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp3Q91W36 520 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PllpQ9DCU2 182 aa27.05■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vmn1r39G3UWE6 305 aa27.04■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfp850J3QPC5 689 aa27.04■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Syce2Q505B8 171 aa27.04■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trcg1Q58Y74 825 aa27.04■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 RetsatQ64FW2 609 aa27.04■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ino80dQ66JY2 873 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PoliQ6R3M4 717 aa27.04■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ChiaQ91XA9 473 aa27.04■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa27.04■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Noxred1Q9D3S5 366 aa27.04■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Stap1Q9JM90 297 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Uts2Q9QZQ3 123 aa27.04■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nupr1Q9WTK0 80 aa27.04■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Itga9B8JK39 1036 aa27.04■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Serpini1O35684 410 aa27.04■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NoctO35710 429 aa27.04■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gpd1lQ3ULJ0 351 aa27.04■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm8773Q3UQ24 132 aa27.04■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Foxd4Q60688 444 aa27.04■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hcn2O88703 863 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ranbp9P69566 653 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Serping1P97290 504 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Aste1Q8BIR2 672 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Serpinb3cA2RSF9 386 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mroh4G3X8W1 983 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PrkcdP28867 674 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tap2P36371 702 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arl4aP61213 200 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kpnb1P70168 876 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dlg3P70175 849 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Thumpd3P97770 505 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kctd8Q50H33 476 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc5a10Q5SWY8 596 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Itm2aQ61500 263 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Armc12Q80X86 340 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tubgcp5Q8BKN5 1024 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atg16l1Q8C0J2 607 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tfb1mQ8JZM0 345 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Acvr1cQ8K348 493 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Elp3Q9CZX0 547 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dcaf6Q9DC22 876 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc13a1Q9JHI4 594 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vmn2r100E9QAZ9 850 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SiaeP70665 541 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf512Q69Z99 562 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Armcx2Q6A058 784 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ScapQ6GQT6 1276 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgap24Q8C4V1 747 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc28bQ8CEG5 200 aa27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 GarsQ9CZD3 729 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmigd3G3X8R9 209 aa27.02■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kcnj6P48542 425 aa27.02■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdo1P60334 200 aa27.02■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cand2Q6ZQ73 1235 aa27.02■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fzd10Q8BKG4 582 aa27.02■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mtm1Q9Z2C5 603 aa27.02■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mtmr7Q9Z2C9 660 aa27.02■■□□□ 1.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gucy2dA0A0U1RPR8 1117 aa27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.4 ms