RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638091.1

CACNB4-273, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 4,061 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-273	ENST00000638091	QSOX1	O00391	747 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	SLC16A4	O15374	487 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	AP1G1	O43747	822 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	CACNG3	O60359	315 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	MGEA5	O60502	916 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	OPHN1	O60890	802 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	GSR	P00390	522 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ADH5	P11766	374 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	FER	P16591	822 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	NTSR1	P30989	418 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	TWF1	Q12792	350 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ZNF77	Q15935	545 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	UGCG	Q16739	394 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	NXPE2	Q96DL1	559 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	PNMA5	Q96PV4	448 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	TBCB	Q99426	244 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	HSF2BP	O75031	334 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	CTDNEP1	O95476	244 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	NR3C1	P04150	777 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ACADM	P11310	421 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	GRIA4	P48058	902 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ERVFC1	P60507	584 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	MYL6	P60660	151 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	YPEL5	P62699	121 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	STK3	Q13188	491 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ZACN	Q401N2	412 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	POTEG	Q6S5H5	508 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	BHMT	Q93088	406 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	VWCE	Q96DN2	955 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	GABRG3	Q99928	467 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ZPBP	Q9BS86	351 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	DUSP16	Q9BY84	665 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	DYRK4	Q9NR20	520 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	PTGES	O14684	152 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	PEX10	O60683	326 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	CLDN11	O75508	207 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	FGFR1	P11362	822 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	MYL4	P12829	197 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	NCOA4	Q13772	614 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	MAP7	Q14244	749 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	NAB2	Q15742	525 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	RNF43	Q68DV7	783 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	OR2T3	Q8NH03	318 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-273	ENST00000638091	NEMP2	A6NFY4	417 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091		A8MXQ7	604 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	ABLIM1	O14639	778 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	DAB1	O75553	588 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	GP1BA	P07359	652 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	MYBL2	P10244	700 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	IL9	P15248	144 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	NPR3	P17342	541 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CACNB4-273	ENST00000638091	SERPINB6	P35237	376 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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