RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619023.4

AKAP9-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 5 BASIC

Gene AKAP9, Length 6,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-216	ENST00000619023	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	PIDD1	Q9HB75	910 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	MAGEB16	A2A368	324 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	SOAT2	O75908	522 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	FAAP100	Q0VG06	881 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	RNF180	Q86T96	592 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	FBXO32	Q969P5	355 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	TMEM237	Q96Q45	408 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	UBP1	Q9NZI7	540 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	CPA4	Q9UI42	421 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	C2orf81	A6NN90	581 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	PLSCR1	O15162	318 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	ALDH1A3	P47895	512 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	TTC23L	Q6PF05	361 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	COG4	Q9H9E3	785 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023		H0Y626	953 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	TBC1D4	O60343	1298 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	LGALS2	P05162	132 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	ITGB5	P18084	799 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	GRK2	P25098	689 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	PTPN7	P35236	360 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC11A2	P49281	568 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	PRELID2	Q8N945	189 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	SYT15	Q9BQS2	421 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	CHST12	Q9NRB3	414 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	C5	P01031	1676 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	ALDH1A1	P00352	501 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	NFIC	P08651	508 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	JAM2	P57087	298 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023		E9PBE3	544 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	CHAD	O15335	359 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	KLHL41	O60662	606 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	ATP9A	O75110	1047 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	FSBP	O95073	299 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	JCHAIN	P01591	159 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	HSPA13	P48723	471 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	RGS4	P49798	205 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	POU4F1	Q01851	419 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	PACS2	Q86VP3	889 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	SHC3	Q92529	594 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	EDEM1	Q92611	657 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	MPP3	Q13368	585 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	CAPS	Q13938	189 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	DYRK4	Q9NR20	520 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		11.7	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	MEI4	A8MW99	385 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	RBL1	P28749	1068 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	STX5	Q13190	355 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	MTFR1	Q15390	333 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	IFNE	Q86WN2	208 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		11.69	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54

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