RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617172.4

TARDBP-218, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 980 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-218	ENST00000617172	MORC3	Q14149	939 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	CNGA2	Q16280	664 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	TMEM270	Q6UE05	265 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	CHPF	Q8IZ52	775 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	PGBD3	Q8N328	593 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	CPXM2	Q8N436	756 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	RNF139	Q8WU17	664 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	HMGB4	Q8WW32	186 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	NELFB	Q8WX92	580 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	PLD4	Q96BZ4	506 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	INVS	Q9Y283	1065 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	SLC12A8	A0AV02	714 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	ANTXRL	A6NF34	631 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172		O00370	1275 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	TIMM44	O43615	452 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	CISD3	P0C7P0	127 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	HOXB2	P14652	356 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	BMP6	P22004	513 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	PAK1	Q13153	545 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	CCDC6	Q16204	474 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	PKDCC	Q504Y2	493 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	STPG1	Q5TH74	334 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	DENND1C	Q8IV53	801 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	UBR7	Q8N806	425 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	LMO3	Q8TAP4	145 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	UCMA	Q8WVF2	138 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	HSFY1	Q96LI6	401 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	10.13	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	PRRT4	C9JH25	899 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	TULP2	O00295	520 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	TM4SF5	O14894	197 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	TRIM24	O15164	1050 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	AP5Z1	O43299	807 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	LATS1	O95835	1130 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	HMBS	P08397	361 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	HOXD12	P35452	270 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	UBE2H	P62256	183 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	ADIG	Q0VDE8	80 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	KCNH2	Q12809	1159 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	MPPE1	Q53F39	396 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	PPM1J	Q5JR12	505 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	FYB2	Q5VWT5	728 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	RNF43	Q68DV7	783 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	UBA3	Q8TBC4	463 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	GOLGA1	Q92805	767 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	BHMT	Q93088	406 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	FAM81B	Q96LP2	452 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	GABRG3	Q99928	467 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	PLK2	Q9NYY3	685 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172		A0A1W2PQF6	199 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172		E7ENQ6	273 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	BIN1	O00499	593 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	FBXO21	O94952	628 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	ADRB1	P08588	477 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	GABRG2	P18507	467 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TARDBP-218	ENST00000617172	BCKDHB	P21953	392 aa		10.11	□□□□□ -0.79

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