RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600393.1

FCHO1-233, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-233	ENST00000600393	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	ISM2	Q6H9L7	571 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	CHPF	Q8IZ52	775 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	CISD3	P0C7P0	127 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	RALA	P11233	206 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	PLA2G4A	P47712	749 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	ENPEP	Q07075	957 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	CACUL1	Q86Y37	369 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	DENND1C	Q8IV53	801 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FCHO1-233	ENST00000600393	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC12A8	A0AV02	714 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	CFI	P05156	583 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	CD19	P15391	556 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SPINK2	P20155	84 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	TKTL1	P51854	596 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	PDE4C	Q08493	712 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	ADIG	Q0VDE8	80 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	CUL2	Q13617	745 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	GEN1	Q17RS7	908 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	RAB41	Q5JT25	222 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	FYB2	Q5VWT5	728 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	UBA3	Q8TBC4	463 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	KAT5	Q92993	513 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC35C1	Q96A29	364 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	TSG101	Q99816	390 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SPEG	Q15772	3267 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	CACNA1G	O43497	2377 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	PIK3R2	O00459	728 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	PSEN1	P49768	467 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	MFAP3	P55082	362 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SYT12	Q8IV01	421 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	UBR7	Q8N806	425 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	DEFB124	Q8NES8	71 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	TFAP2B	Q92481	460 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	EDEM1	Q92611	657 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SMARCE1	Q969G3	411 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	GABRG3	Q99928	467 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	RMND1	Q9NWS8	449 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	NUMA1	Q14980	2115 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	STX10	O60499	249 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	TSPAN3	O60637	253 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	GABBR2	O75899	941 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	ZBED1	O96006	694 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	ENG	P17813	658 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	IL12RB1	P42701	662 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	RGS7	P49802	495 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	FOXC1	Q12948	553 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	FUT11	Q495W5	492 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	SGO2	Q562F6	1265 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		13.5	□□□□□ -0.25
FCHO1-233	ENST00000600393	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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