RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SCAPQ12770 1279 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 LRP8Q14114 963 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 METTL24Q5JXM2 366 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM205BPQ63HN1 556 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 OLFML2BQ68BL8 750 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF529Q6P280 563 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 BBS12Q6ZW61 710 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 RRAGAQ7L523 313 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 TTLL6Q8N841 843 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5M3Q8NGP4 307 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC35B2Q8TB61 432 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ST8SIA4Q92187 359 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ZUFSPQ96AP4 578 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM89AQ96GI7 184 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 NEK1Q96PY6 1258 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 TWNKQ96RR1 684 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R9BQ96SB3 815 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ENKD1Q9H0I2 346 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKEF1Q9NU02 776 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM184BQ9ULE4 1060 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CA14Q9ULX7 337 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 MAST3O60307 1309 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ATRNO75882 1429 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa4.61□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 LY75O60449 1722 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 C4AP0C0L4 1744 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 C4BP0C0L5 1744 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 MAST2Q6P0Q8 1798 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ECM29Q5VYK3 1845 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CCP110O43303 1012 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBED4O75132 1171 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 COQ9O75208 318 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 TIPRLO75663 272 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 HAUS5O94927 633 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 LARGE1O95461 756 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 JUNP05412 331 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 FDXRP22570 491 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ADCY7P51828 1080 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 WNT3P56703 355 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 BPIFB4P59827 614 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 TIMM10P62072 90 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAM8P78325 824 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNAB1Q14722 419 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 HLFQ16534 295 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 MEA1Q16626 185 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ME3Q16798 604 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 PARP10Q53GL7 1025 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 FAXCQ5TGI0 409 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ARMC3Q5W041 872 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM160B1Q5W0V3 765 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 HAUS3Q68CZ6 603 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ACAD10Q6JQN1 1059 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 MRNIPQ6NTE8 343 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SP8Q8IXZ3 490 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 AOPEPQ8N6M6 819 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM46DQ8NEK8 389 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 NUDT10Q8NFP7 164 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 DNERQ8NFT8 737 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 RSC1A1Q92681 617 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 LPPQ93052 612 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SCAMP4Q969E2 229 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 NUDT11Q96G61 164 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 C7orf26Q96N11 449 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 MESP1Q9BRJ9 268 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 SDF4Q9BRK5 362 aa4.6□□□□□ -1.67
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR63Q9BZJ6 419 aa4.6□□□□□ -1.67
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