RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 AP1M1Q9BXS5 423 aa5.88□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 TAOK3Q9H2K8 898 aa5.88□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 SYNCQ9H7C4 482 aa5.88□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa5.88□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5.88□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa5.88□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 SNX14Q9Y5W7 946 aa5.88□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 MYADML2A6NDP7 307 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 TCAF2A6NFQ2 919 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM225BP0DP42 221 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 LAMP2P13473 410 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 DRD1P21728 446 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 THBS4P35443 961 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 PBX1P40424 430 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 MLH1P40692 756 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 EPHB4P54760 987 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 MESP2Q0VG99 397 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 MTAPQ13126 283 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 MPP3Q13368 585 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 AAK1Q2M2I8 961 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM69AQ5T7M9 428 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 DEPDC1Q5TB30 811 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM90A2PQ658T7 463 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM151BQ8IW70 566 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 ADGRG5Q8IZF4 528 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 LGI4Q8N135 537 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 LINS1Q8NG48 757 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 MCRS1Q96EZ8 462 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 OR14A2Q96R54 314 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 HAPLN3Q96S86 360 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 RMI1Q9H9A7 625 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 VEZTQ9HBM0 779 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 SERTAD3Q9UJW9 196 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 AATKQ6ZMQ8 1374 aa5.87□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 A8MVJ9 347 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 AP3D1O14617 1153 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 RPN1P04843 607 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 MMP8P22894 467 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 YY1P25490 414 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 GALNSP34059 522 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 PCP4P48539 62 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 OCA2Q04671 838 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 FPGSQ05932 587 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 SEMA3BQ13214 749 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 FZD5Q13467 585 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 CBFBQ13951 182 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 KCNJ12Q14500 433 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 ALDH1L2Q3SY69 923 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 RILPL1Q5EBL4 403 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 SPECC1Q5M775 1068 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 SLFN13Q68D06 897 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 HTR3DQ70Z44 454 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 KRT74Q7RTS7 529 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 PXKQ7Z7A4 578 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 TAX1BP1Q86VP1 789 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 D2HGDHQ8N465 521 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 ETNPPLQ8TBG4 499 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 ATG4AQ8WYN0 398 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 SH3KBP1Q96B97 665 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM136AQ96C01 138 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 RSPRY1Q96DX4 576 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 ZSWIM1Q9BR11 485 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 SORCS3Q9UPU3 1222 aa5.86□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa5.85□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa5.85□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 TBC1D3EA0A087X179 549 aa5.85□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa5.85□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa5.85□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa5.85□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 TBC1D3BA6NDS4 549 aa5.85□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 GAGE10A6NGK3 116 aa5.85□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 ZAR1LA6NP61 321 aa5.85□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa5.85□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 TBC1D3LB9A6J9 549 aa5.85□□□□□ -1.47
PIK3C3-211ENST00000589550 LEFTY2O00292 366 aa5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms