RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	IL17A	Q16552	155 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	BEND4	Q6ZU67	534 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	FRMD1	Q8N878	549 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	LEMD2	Q8NC56	503 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	DEFB124	Q8NES8	71 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	KIFAP3	Q92845	792 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ISL2	Q96A47	359 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	E2F7	Q96AV8	911 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	IFT74	Q96LB3	600 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	GKN1	Q9NS71	199 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ATM	Q13315	3056 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	APC2	O95996	2303 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	LACTBL1	A8MY62	500 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TISP43	B9A030	160 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TAF4	O00268	1085 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	HCRT	O43612	131 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	AKAP3	O75969	853 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	NFIC	P08651	508 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	GBP1	P32455	592 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	GALK1	P51570	392 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM193A	P78312	1265 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	MCL1	Q07820	350 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	RUNX3	Q13761	415 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	DMC1	Q14565	340 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF77	Q15935	545 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	GAB4	Q2WGN9	574 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TTC38	Q5R3I4	469 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC6A19	Q695T7	634 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TXNDC8	Q6A555	127 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	HID1	Q8IV36	788 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	FBXO27	Q8NI29	283 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	WASF1	Q92558	559 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SENP8	Q96LD8	212 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC22A12	Q96S37	553 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TCHP	Q9BT92	498 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	GPR88	Q9GZN0	384 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		4.26	□□□□□ -1.73

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