RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569304.1

RAB11A-208, Transcript of RAB11A, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB11A, Length 347 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB11A-208	ENST00000569304	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	PBK	Q96KB5	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	PRR25	Q96S07	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	DERA	Q9Y315	318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB11A-208	ENST00000569304	MPPED1	O15442	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	NXPH3	O95157	252 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	CHRM2	P08172	466 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	CREB1	P16220	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	XBP1	P17861	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	PTGS2	P35354	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	FOLR3	P41439	243 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	TRPC3	Q13507	836 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	AAK1	Q2M2I8	961 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	HTRA1	Q92743	480 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	FBXL20	Q96IG2	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304		Q96MF0	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304		A6NLC8	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304		M0QYT0	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	NKX2-8	O15522	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	PEX1	O43933	1283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	ALAD	P13716	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	MMP8	P22894	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	ADRA1D	P25100	572 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	CTGF	P29279	349 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	THBS4	P35443	961 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	E2F1	Q01094	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	BFSP2	Q13515	415 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304		Q6ZWC4	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	USP51	Q70EK9	711 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	MAST3	O60307	1309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	AP4M1	O00189	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	CA12	O43570	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	MBD4	O95243	580 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	CD4	P01730	458 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	ADRB1	P08588	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB11A-208	ENST00000569304	ITPKB	P27987	946 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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