RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568588.5

RPL4-215, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2 BASIC

Gene RPL4, Length 1,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-215	ENST00000568588	PSMC3	P17980	439 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	GALC	P54803	685 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	GPC5	P78333	572 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	RING1	Q06587	406 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	H2AFV	Q71UI9	128 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	TAC4	Q86UU9	113 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	PLD4	Q96BZ4	506 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	NPY6R	Q99463	290 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	KXD1	Q9BQD3	176 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	THAP2	Q9H0W7	228 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	GKN1	Q9NS71	199 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	NCOR1	O75376	2440 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	SLC12A8	A0AV02	714 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	IRAK2	O43187	625 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	GREM1	O60565	184 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	STC2	O76061	302 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	IGLV3-27	P01718	113 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	TMEM253	P0C7T8	217 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	ABCB4	P21439	1286 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	GBP1	P32455	592 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	PTPN9	P43378	593 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	MTF1	Q14872	753 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	SPA17	Q15506	151 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	TRNP1	Q6NT89	227 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	HTR3D	Q70Z44	454 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	BNIPL	Q7Z465	357 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	EMC1	Q8N766	993 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	RIN3	Q8TB24	985 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	SLC39A13	Q96H72	371 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	MCEE	Q96PE7	176 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	TTC28	Q96AY4	2481 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	VCAN	P13611	3396 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	CHAD	O15335	359 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	ENDOD1	O94919	500 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	F9	P00740	461 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	ASGR2	P07307	311 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	PDGFRA	P16234	1089 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	SDC4	P31431	198 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	TDG	Q13569	410 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	RNF135	Q8IUD6	432 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	OTUB2	Q96DC9	234 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	DCLK3	Q9C098	648 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	DDIT4	Q9NX09	232 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588		M0QYT0	321 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	GJB6	O95452	261 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	LATS1	O95835	1130 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	SLC2A3	P11169	496 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	GPD1	P21695	349 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	MAGEA1	P43355	309 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	SULT1E1	P49888	294 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	TBX4	P57082	545 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	MTA1	Q13330	715 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	CCDC14	Q49A88	953 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RPL4-215	ENST00000568588		Q6ZNB5	142 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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