RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 ARMC7Q9H6L4 198 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TMEM191CA6NGB0 347 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TPST1O60507 370 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ITPKBP27987 946 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 NR1I3Q14994 352 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TMEM199Q8N511 208 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TOP1MTQ969P6 601 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 DPP7Q9UHL4 492 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 hCG_1984214I3L0E3 225 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 MPOP05164 745 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 VAV1P15498 845 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 MDH1P40925 334 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TSPAN17Q96FV3 270 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SLC28A3Q9HAS3 691 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CCDC188H7C350 402 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 LTFP02788 710 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 MYBL1P10243 752 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 PCSK1P29120 753 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SEC24CP53992 1094 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CENPCQ03188 943 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 OVGP1Q12889 678 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CNGA3Q16281 694 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 UBP1Q9NZI7 540 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SNX12Q9UMY4 172 aa8.68□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 GRID2IPA4D2P6 1211 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 GARTP22102 1010 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 EPHB2P29323 1055 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ELK3P41970 407 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ATAD3BQ5T9A4 648 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 NAXEQ8NCW5 288 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 DPY30Q9C005 99 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ZMYM5Q9UJ78 669 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ALG6Q9Y672 507 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CYB561D2O14569 222 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 DLGAP3O95886 979 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 IL1R1P14778 569 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 GALCP54803 685 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CYP4Z1Q86W10 505 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ULK2Q8IYT8 1036 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CHPFQ8IZ52 775 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SUN3Q8TAQ9 357 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 FAM129BQ96TA1 746 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 GINS4Q9BRT9 223 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 DDIT4Q9NX09 232 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CDYLQ9Y232 598 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 FLT1P17948 1338 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TBC1D3EA0A087X179 549 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TBC1D3LB9A6J9 549 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TBC1D3HP0C7X1 549 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 GHRP10912 638 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 UGT3A1Q6NUS8 523 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 LPCAT1Q8NF37 534 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 C18orf8Q96DM3 657 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SERHLQ9NQF3 203 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 NMRK1Q9NWW6 199 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 KIAA1257Q9ULG3 409 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 MYPNQ86TC9 1320 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 HYKKA2RU49 373 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 GYPCP04921 128 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ALCAMQ13740 583 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 GFOD2Q3B7J2 385 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 FGD3Q5JSP0 725 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CBWD3Q5JTY5 395 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 CBWD5Q5RIA9 395 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 ISLR2Q6UXK2 745 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 SPATA21Q7Z572 469 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 RNFT2Q96EX2 444 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa8.67□□□□□ -1.02
PDPR-210ENST00000568530 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms