RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561689.6

CLN3-209, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 2

Gene CLN3, Length 1,957 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-209ENST00000561689 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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CLN3-209ENST00000561689 TRIM62Q9BVG3 475 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN3-209ENST00000561689 ANLNQ9NQW6 1124 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN3-209ENST00000561689 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.11■■□□□ 1.13
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CLN3-209ENST00000561689 PRUNE1Q86TP1 453 aa22.09■■□□□ 1.13
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CLN3-209ENST00000561689 C10orf88Q9H8K7 445 aa22.09■■□□□ 1.13
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CLN3-209ENST00000561689 HERVK_113Q902F9 699 aa22.07■■□□□ 1.12
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CLN3-209ENST00000561689 NTAN1Q96AB6 310 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN3-209ENST00000561689 TKTL2Q9H0I9 626 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN3-209ENST00000561689 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CLN3-209ENST00000561689 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CLN3-209ENST00000561689 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.07■■□□□ 1.12
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