RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 FRYLO94915 3013 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRRG2O14669 202 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 MBTPS2O43462 519 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 TOP1P11387 765 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF20P17024 532 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 CASTP20810 708 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCND1P24385 295 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 ECHS1P30084 290 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 WASP42768 502 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 HHEXQ03014 270 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 HYAL1Q12794 435 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPM6BQ13491 265 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 ODF1Q14990 250 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 VPS53Q5VIR6 699 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 TOP1MTQ969P6 601 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 NCANO14594 1321 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 TTC41PQ6P2S7 1318 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 SALL3Q9BXA9 1300 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 CAND2O75155 1236 aa9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 NOMO1Q15155 1222 aa9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 DENND4AQ7Z401 1863 aa9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR7D4Q8NG98 312 aa9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADOQ96SZ5 270 aa9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 YME1L1Q96TA2 773 aa9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 LMAN2LQ9H0V9 348 aa9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 DNM3Q9UQ16 869 aa9.69□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABCB11O95342 1321 aa9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 B4DLN1 442 aa9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 MMP1P03956 469 aa9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 APBA1Q02410 837 aa9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM214AQ32MH5 1076 aa9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 HSDL1Q3SXM5 330 aa9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 USH1GQ495M9 461 aa9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 SEPT14Q6ZU15 432 aa9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZBTB46Q86UZ6 589 aa9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 SGMS1Q86VZ5 419 aa9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 NRG4Q8WWG1 115 aa9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 MIEF2Q96C03 454 aa9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 IWS1Q96ST2 819 aa9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 KAT6AQ92794 2004 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM171A2A8MVW0 826 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 GRM6O15303 877 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC01565O15544 149 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 NCK2O43639 380 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 ENDOD1O94919 500 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 RSPH10BP0C881 870 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 CAMK1Q14012 370 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDSNQ15517 529 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 ALX1Q15699 326 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHST3Q7LGC8 479 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMRP1Q8NCR6 262 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR2I1PQ8NGU4 316 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 TBC1D5Q92609 795 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 TAAR1Q96RJ0 339 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 RMDN3Q96TC7 470 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 FSD1Q9BTV5 496 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 CPVLQ9H3G5 476 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 DCTPP1Q9H773 170 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 PXMP2Q9NR77 195 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 TESMINQ9Y4I5 508 aa9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 FRMPD4Q14CM0 1322 aa9.66□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC171Q6TFL3 1326 aa9.66□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM221A6NGB7 291 aa9.66□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 CAPN14A8MX76 684 aa9.66□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 M0R296 226 aa9.66□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 MUSKO15146 869 aa9.66□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 GLP2RO95838 553 aa9.66□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 CTNNB1P35222 781 aa9.66□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 SREBF1P36956 1147 aa9.66□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 THPOP40225 353 aa9.66□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 HSD17B4P51659 736 aa9.66□□□□□ -0.86
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC16A1P53985 500 aa9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms