RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557685.5

EFCAB11-213, Transcript of EF-hand calcium binding domain 11, human

TSL 3

Gene EFCAB11, Length 698 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFCAB11-213	ENST00000557685	THAP4	Q8WY91	577 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685		B9A039	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	PPP6R2	O75170	966 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	ZNF202	O95125	648 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	ADH4	P08319	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	PCSK6	P29122	969 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	MCM7	P33993	719 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	FOXI1	Q12951	378 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	CUL4B	Q13620	913 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	TAF12	Q16514	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	CPT1B	Q92523	772 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFCAB11-213	ENST00000557685	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	QSOX1	O00391	747 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	NPS	P0C0P6	89 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	ENG	P17813	658 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	PRKAA2	P54646	552 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	ACTR2	P61160	394 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	BFSP2	Q13515	415 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	LINC00473	A8K010	186 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685		E7EVH7	732 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685		H0YIZ8	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	NCAM2	O15394	837 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	CA12	O43570	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	TK1	P04183	234 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	CKMT1A	P12532	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	DIO1	P49895	249 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	CCT8	P50990	548 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFCAB11-213	ENST00000557685	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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