RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557295.1

LINC00640-204, long intergenic non-protein coding RNA 640, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00640, Length 708 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00640-204ENST00000557295 ZPBP2Q6X784 338 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 LRRTM3Q86VH5 581 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 TCEAL8Q8IYN2 117 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 LEMD2Q8NC56 503 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF461Q8TAF7 563 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 BICD2Q8TD16 824 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 GJA10Q969M2 543 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 CPB2Q96IY4 423 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 CEP170P1Q96L14 293 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 NFKBIZQ9BYH8 718 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 LRRC2Q9BYS8 371 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00640-204ENST00000557295 MYH6P13533 1939 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.4□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 MAST4O15021 2626 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 NCANO14594 1321 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 SLC38A8A6NNN8 435 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 HEPACAM2A8MVW5 462 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PRRG1O14668 218 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PTGESO14684 152 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 MOSPD3O75425 235 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CAVIN2O95810 425 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 THP07101 528 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ATF2P15336 505 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CPEP16870 476 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 IGFALSP35858 605 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CD96P40200 585 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PXNP49023 591 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ROR1Q01973 937 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TFDP1Q14186 410 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 EMC2Q15006 297 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ELF2Q15723 593 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TM4SF20Q53R12 229 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TTC22Q5TAA0 569 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PROSER1Q86XN7 944 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ETNPPLQ8TBG4 499 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 RSPRY1Q96DX4 576 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 C1orf159Q96HA4 380 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 GPR88Q9GZN0 384 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CAAP1Q9H8G2 361 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TMEM9BQ9NQ34 198 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 DOCK8Q8NF50 2099 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 SLC27A2O14975 620 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 GSTA4O15217 222 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 B4GALT5O43286 388 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TRAPPC3O43617 180 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ATG13O75143 517 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 RHOBTB1O94844 696 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 NPTXRO95502 500 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ELF1P32519 619 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PAK1Q13153 545 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PPP2R5CQ13362 524 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 MSMPQ1L6U9 139 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 MOXD1Q6UVY6 613 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 OTUD6AQ7L8S5 288 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 C4orf19Q8IY42 314 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 YAF2Q8IY57 180 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 OXR1Q8N573 874 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 PCDH12Q9NPG4 1184 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 MAFFQ9ULX9 164 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 SLC8A2Q9UPR5 921 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 INSL5Q9Y5Q6 135 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 LOC400499M0QZD8 3231 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 BPTFQ12830 3046 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 LAMA5O15230 3695 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 TMEM82A0PJX8 343 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00640-204ENST00000557295 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms