RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554340.1

NEMP1-204, Transcript of nuclear envelope integral membrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEMP1, Length 1,381 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP1-204ENST00000554340 MDM4O15151 490 aa21.53■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 AP5Z1O43299 807 aa21.53■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 HOXD12P35452 270 aa21.53■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 WASP42768 502 aa21.53■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 SDE2Q6IQ49 451 aa21.53■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 SCD5Q86SK9 330 aa21.53■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 CHPFQ8IZ52 775 aa21.53■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 EEF2KMTQ96G04 330 aa21.53■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 CD248Q9HCU0 757 aa21.53■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 PILRBQ9UKJ0 227 aa21.53■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa21.53■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 PRRT4C9JH25 899 aa21.52■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa21.52■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 SLC23A3Q6PIS1 610 aa21.52■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 SLC36A4Q6YBV0 504 aa21.52■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa21.52■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 SPATA20Q8TB22 786 aa21.52■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 ACOX2Q99424 681 aa21.52■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 GABRG3Q99928 467 aa21.52■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 CLIC5Q9NZA1 410 aa21.52■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 USP3Q9Y6I4 520 aa21.52■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NEMP1-204ENST00000554340 PCDH15Q96QU1 1955 aa21.51■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 STC2O76061 302 aa21.51■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 CISD3P0C7P0 127 aa21.51■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 RALAP11233 206 aa21.51■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 CEACAM1P13688 526 aa21.51■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 ITPKAP23677 461 aa21.51■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 DGKGP49619 791 aa21.51■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 ZNF394Q53GI3 561 aa21.51■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 ANKRD40Q6AI12 368 aa21.51■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 TMEM176AQ96HP8 235 aa21.51■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 CISHQ9NSE2 258 aa21.51■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 ZNF217O75362 1048 aa21.5■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 ENGP17813 658 aa21.5■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 UAP1L1Q3KQV9 507 aa21.5■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 SEMA4DQ92854 862 aa21.5■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.5■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 FAM208BQ5VWN6 2430 aa21.5■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 ZZEF1O43149 2961 aa21.5■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa21.49■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 NDUFV2P19404 249 aa21.49■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 MAPK8P45983 427 aa21.49■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 KIAA1211LQ6NV74 962 aa21.49■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.49■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 SLC4A11Q8NBS3 891 aa21.49■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 CEP76Q8TAP6 659 aa21.49■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 BHMTQ93088 406 aa21.49■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.49■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 RASAL2Q9UJF2 1139 aa21.49■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 FBXO10Q9UK96 956 aa21.49■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 ZFHX4Q86UP3 3567 aa21.49■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 GFRA2O00451 464 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 KLKB1P03952 638 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 COG7P83436 770 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 CETN1Q12798 172 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 DUOXA1Q1HG43 343 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 P2RY11Q96G91 374 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 CEP63Q96MT8 703 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 DCLK3Q9C098 648 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 PLK2Q9NYY3 685 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 SLC6A14Q9UN76 642 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 PENKP01210 267 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 CFIP05156 583 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 CHKAP35790 457 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 RAD23BP54727 409 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 ZNF33AQ06730 810 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 EFEMP1Q12805 493 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 FOXC1Q12948 553 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 ARHGAP17Q68EM7 881 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 RABEPKQ7Z6M1 372 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 DEFB119Q8N690 84 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 DEFB124Q8NES8 71 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 TATDN2Q93075 761 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 ARID3AQ99856 593 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 CYP8B1Q9UNU6 501 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 WASF3Q9UPY6 502 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 RAD54BQ9Y620 910 aa21.48■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 CKAP5Q14008 2032 aa21.47■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 BICDL2A1A5D9 508 aa21.47■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 SERPINF2P08697 491 aa21.47■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 RAB41Q5JT25 222 aa21.47■■□□□ 1.03
NEMP1-204ENST00000554340 FYB2Q5VWT5 728 aa21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms