RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	INCA1	Q0VD86	236 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	SCD5	Q86SK9	330 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	TMC2	Q8TDI7	906 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	TAF4B	Q92750	862 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	BACH2	Q9BYV9	841 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		13.25	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	GFRA2	O00451	464 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	KLKB1	P03952	638 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	SYP	P08247	313 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	PLA2G4A	P47712	749 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	KIF11	P52732	1056 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	FUT11	Q495W5	492 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	CEP135	Q66GS9	1140 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	PAGE5	Q96GU1	130 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	EXOC1	Q9NV70	894 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	NAGPA	Q9UK23	515 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	FBXO10	Q9UK96	956 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		13.24	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	PLXNA2	O75051	1894 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931		H0Y626	953 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	TAF4	O00268	1085 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	PDXK	O00764	312 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	IKBKB	O14920	756 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	SH3BP5	O60239	455 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	NDUFS2	O75306	463 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIM16	O95361	564 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	F13A1	P00488	732 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	CAPNS1	P04632	268 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	SLFN14	P0C7P3	912 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIM49	P0CI25	452 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIM49C	P0CI26	452 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	CD58	P19256	250 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	IL12RB1	P42701	662 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	MFAP3	P55082	362 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	RING1	Q06587	406 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	GRIK2	Q13002	908 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	PKP1	Q13835	747 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	GEN1	Q17RS7	908 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	FYB2	Q5VWT5	728 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		13.23	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	BPTF	Q12830	3046 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	KCNJ18	B7U540	433 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	CILP	O75339	1184 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	HMBS	P08397	361 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	CD6	P30203	668 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	GCLM	P48507	274 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	VAMP7	P51809	220 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	PPP3CA	Q08209	521 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC14A1	Q13336	389 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	ENPP2	Q13822	863 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	NAXD	Q8IW45	347 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF276	Q8N554	614 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	FOXJ1	Q92949	421 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	GPR174	Q9BXC1	333 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	USP3	Q9Y6I4	520 aa		13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	KIF20A	O95235	890 aa		13.21	□□□□□ -0.29
LETMD1-231	ENST00000551931	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		13.21	□□□□□ -0.29

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