RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 CCNE1P24864 410 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PSMA2P25787 234 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RPS6P62753 249 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PPP2R2AP63151 447 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PRKCEQ02156 737 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 GARNL3Q5VVW2 1013 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 C4orf22Q6V702 233 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 COG1Q8WTW3 980 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SCFD1Q8WVM8 642 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PIGKQ92643 395 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TIFAQ96CG3 184 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CHID1Q9BWS9 393 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 KCNJ18B7U540 433 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PFKFB1P16118 471 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 GPD2P43304 727 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 KCNJ12Q14500 433 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 STX19Q8N4C7 294 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ASB12Q8WXK4 309 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TTC17Q96AE7 1141 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 LY9Q9HBG7 655 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ING3Q9NXR8 418 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA1257Q9ULG3 409 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 NRCAMQ92823 1304 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 STX7O15400 261 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 APOL3O95236 402 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 ITGA2BP08514 1039 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 PCSK7Q16549 785 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 HECTD3Q5T447 861 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 VPS35Q96QK1 796 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF212Q9UDV6 495 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 LSP1P33241 339 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PPP3CCP48454 512 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TP53BP2Q13625 1128 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 IGSF11Q5DX21 431 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRB-210ENST00000551525 BORCS6Q96GS4 357 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 VPS39Q96JC1 886 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 COG8Q96MW5 612 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 CITED4Q96RK1 184 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DCLRE1BQ9H816 532 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 NEDD4P46934 1319 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DPPA5A6NC42 116 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DNM1LO00429 736 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 PEX1O43933 1283 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 KRT36O76013 467 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 NFICP08651 508 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 EVI2BP34910 448 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-210ENST00000551525 DLG4P78352 724 aa6.49□□□□□ -1.37
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