RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 ZSWIM1Q9BR11 485 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 TMEM74BQ9NUR3 256 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 STYXL1Q9Y6J8 313 aa7.9□□□□□ -1.14
CS-212ENST00000548567 FAM149AA5PLN7 773 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 C4orf47A7E2U8 309 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 CYP17A1P05093 508 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 GKP32189 559 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 STK19P49842 368 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 SLC8A3P57103 927 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 RAP1GAP2Q684P5 730 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 DENND1BQ6P3S1 775 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 PDXDC1Q6P996 788 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 KRT222Q8N1A0 295 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 LRRC52Q8N7C0 313 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 SLC4A11Q8NBS3 891 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 ENGASEQ8NFI3 743 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 ABCB8Q9NUT2 735 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 EPS15L1Q9UBC2 864 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
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CS-212ENST00000548567 SHISA7A6NL88 538 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 SMTNL1A8MU46 457 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 E5RJQ4 531 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 RPP40O75818 363 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 CLCN5P51795 746 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 RAD23BP54727 409 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 CENPCQ03188 943 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 SGO2Q562F6 1265 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 DRC7Q8IY82 874 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
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CS-212ENST00000548567 WFDC5Q8TCV5 224 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 WHAMMQ8TF30 809 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 RUBCNQ92622 972 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 GPR174Q9BXC1 333 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 PARD6AQ9NPB6 346 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 MPP6Q9NZW5 540 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 VANGL2Q9ULK5 521 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 PLXNA3P51805 1871 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 ARHGEF37A1IGU5 675 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 ANHXE9PGG2 379 aa7.89□□□□□ -1.15
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CS-212ENST00000548567 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 SDC3O75056 442 aa7.89□□□□□ -1.15
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CS-212ENST00000548567 METAP1P53582 386 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 FOXC1Q12948 553 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 CUL2Q13617 745 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 MORC3Q14149 939 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 CRTC1Q6UUV9 634 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 TTC30BQ8N4P2 665 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 FAM53CQ9NYF3 392 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 USP25Q9UHP3 1055 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 UNC13CQ8NB66 2214 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 GABRDO14764 452 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 EFEMP2O95967 443 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 ADH5P11766 374 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 DENND2CQ68D51 928 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 FAM131BQ86XD5 332 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 KIF18AQ8NI77 898 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 ELSPBP1Q96BH3 223 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 EXOC2Q96KP1 924 aa7.88□□□□□ -1.15
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CS-212ENST00000548567 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 CUEDC2Q9H467 287 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 YY1AP1Q9H869 796 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 KIAA1586Q9HCI6 787 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 A0A0U1RQS6 177 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 EPHB6O15197 1021 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 CASC3O15234 703 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-212ENST00000548567 FSBPO95073 299 aa7.88□□□□□ -1.15
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