RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 LILRA6Q6PI73 481 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 BEND5Q7L4P6 421 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 PRELID2Q8N945 189 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 ABCC13Q9NSE7 274 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 STAP1Q9ULZ2 295 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 PLXNA3P51805 1871 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 TGM5O43548 720 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 IL4RP24394 825 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 DEUP1Q05D60 604 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 ADGRE1Q14246 886 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 TAC4Q86UU9 113 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 TCEAL8Q8IYN2 117 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 KCTD6Q8NC69 237 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 UBXN4Q92575 508 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 FBXO32Q969P5 355 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 MYO7AQ13402 2215 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 C1RP00736 705 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 MMRN1Q13201 1228 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 ERMARDQ5T6L9 678 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 CASP10Q92851 521 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 YIPF1Q9Y548 306 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 IGLV3-25P01717 112 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 ELF2Q15723 593 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 KAZNQ674X7 775 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 KLHL7Q8IXQ5 586 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 PYROXD2Q8N2H3 581 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 TEKT4Q8WW24 435 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 MYLIPQ8WY64 445 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 KRT12Q99456 494 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 COMMD8Q9NX08 183 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 DDIT4Q9NX09 232 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 DPP7Q9UHL4 492 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 FZD10Q9ULW2 581 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 TBX18O95935 607 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 RHOXF2BP0C7M4 288 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 L1CAMP32004 1257 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 HINFPQ9BQA5 517 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-209ENST00000532457 MDM4O15151 490 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 NRIP1P48552 1158 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 CDH6P55285 790 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 COPS2P61201 443 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 TWF1Q12792 350 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 DPYSL3Q14195 570 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 TFDP3Q5H9I0 405 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 PCDH18Q9HCL0 1135 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 RRN3Q9NYV6 651 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 REV3LO60673 3130 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 PRRG1O14668 218 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 PER2O15055 1255 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 GLUD1P00367 558 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 FOSL2P15408 326 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 DESP17661 470 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 ELF1P32519 619 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 PTPN7P35236 360 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 ALDH1A3P47895 512 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 CXCR3P49682 368 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 DUSP6Q16828 381 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM71BQ8TC56 605 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 GUCD1Q96NT3 240 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-209ENST00000532457 MAFFQ9ULX9 164 aa22.82■■□□□ 1.24
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