RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525725.5

PACSIN3-203, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-203ENST00000525725 LPCAT2Q7L5N7 544 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-203ENST00000525725 TATDN2Q93075 761 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-203ENST00000525725 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-203ENST00000525725 ACOX2Q99424 681 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-203ENST00000525725 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-203ENST00000525725 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-203ENST00000525725 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-203ENST00000525725 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-203ENST00000525725 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-203ENST00000525725 RALAP11233 206 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-203ENST00000525725 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-203ENST00000525725 DGKGP49619 791 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-203ENST00000525725 CUL2Q13617 745 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-203ENST00000525725 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-203ENST00000525725 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-203ENST00000525725 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-203ENST00000525725 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-203ENST00000525725 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-203ENST00000525725 ZNF510Q9Y2H8 683 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-203ENST00000525725 CHD6Q8TD26 2715 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-203ENST00000525725 GFRA2O00451 464 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 KCNK5O95279 499 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 NDUFV2P19404 249 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 BCAT1P54687 386 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 COG7P83436 770 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 ENPP2Q13822 863 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 KIAA1211LQ6NV74 962 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 SYT12Q8IV01 421 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 TIGD1Q96MW7 591 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 TSG101Q99816 390 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 ZZEF1O43149 2961 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 C4orf47A7E2U8 309 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 TULP2O00295 520 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 PMM2O15305 246 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 DPP6P42658 865 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 MFAP3P55082 362 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 PKDCCQ504Y2 493 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 TMEFF1Q8IYR6 380 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 CHPFQ8IZ52 775 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 CPXM2Q8N436 756 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 TMEM9BQ9NQ34 198 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 TMEM74BQ9NUR3 256 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 PILRBQ9UKJ0 227 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 AKAP13Q12802 2813 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 O00370 1275 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 SMC2O95347 1197 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 TKTL1P51854 596 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 IRX4P78413 519 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 PDE4CQ08493 712 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 EFEMP1Q12805 493 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 LYSMD4Q5XG99 296 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 SCML4Q8N228 414 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 PIGKQ92643 395 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 ULBP1Q9BZM6 244 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 DCLK3Q9C098 648 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 PLK2Q9NYY3 685 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 ZBED1O96006 694 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 CHKAP35790 457 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 NUMA1Q14980 2115 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 TRIM61Q5EBN2 209 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 SLC23A3Q6PIS1 610 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 BHMTQ93088 406 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 SMARCE1Q969G3 411 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 PLD4Q96BZ4 506 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 AP5Z1O43299 807 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 SETSIPP0DME0 302 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 ITPKAP23677 461 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 WASP42768 502 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 FMO5P49326 533 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 SLC8A3P57103 927 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-203ENST00000525725 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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