RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524356.1

PCM1-223, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 2

Gene PCM1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-223	ENST00000524356	ZACN	Q401N2	412 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	MSRA	Q9UJ68	235 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	GPR34	Q9UPC5	381 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	MYOM1	P52179	1685 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	ROCK1	Q13464	1354 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	APOL1	O14791	398 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	GPANK1	O95872	356 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	CD40	P25942	277 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	HOXC13	P31276	330 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	ITGA8	P53708	1063 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	NR1H2	P55055	460 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	NRG3	P56975	720 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	DACT1	Q9NYF0	836 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	RREB1	Q92766	1687 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	SSH2	Q76I76	1423 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	CASZ1	Q86V15	1759 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356		A0A1W2PPC4	97 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	TSPY2	A6NKD2	308 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	SYT5	O00445	386 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	WNT10B	O00744	389 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	NPC1	O15118	1278 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	ADCY6	O43306	1168 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	PLA2G6	O60733	806 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	LATS1	O95835	1130 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	LPL	P06858	475 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	TH	P07101	528 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	TSPY3	P0CV98	308 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	TSPY8	P0CW00	308 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	CTSS	P25774	331 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	CCKAR	P32238	428 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	GRIA3	P42263	894 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	MAP2K6	P52564	334 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	SLC16A1	P53985	500 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	SOX10	P56693	466 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	TSPY1	Q01534	308 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	FOXO1	Q12778	655 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	DAG1	Q14118	895 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	KIF22	Q14807	665 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	UGT8	Q16880	541 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	MUM1	Q2TAK8	710 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	MIDN	Q504T8	468 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	CPO	Q8IVL8	374 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	SNX33	Q8WV41	574 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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