RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 DGKAP23743 735 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 ALDH4A1P30038 563 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 IL2P60568 153 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 KIF22Q14807 665 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 UGP2Q16851 508 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 PPP4R3AQ6IN85 833 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 METTL7BQ6UX53 244 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 USP37Q86T82 979 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 ADIPOR2Q86V24 386 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 ABRAQ8N0Z2 381 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 CADM3Q8N126 398 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 FGFRL1Q8N441 504 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 FBXL16Q8N461 479 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR2W6PQ8NHA6 318 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 OSBPL2Q9H1P3 480 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 TCF7L1Q9HCS4 588 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 PAK5Q9P286 719 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 MGAT4CQ9UBM8 478 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 HESX1Q9UBX0 185 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 DNM3Q9UQ16 869 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZHX2Q9Y6X8 837 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 A0A1B0GVT2 93 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC22A23A1A5C7 686 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 VWA5AO00534 786 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCP110O43303 1012 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 FGF17O60258 216 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 ULK1O75385 1050 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 FKBP9O95302 570 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 LCATP04180 440 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 WNT1P04628 370 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 DUX4L4P0CJ87 422 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 CHRNB1P11230 501 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 CYP2C9P11712 490 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF12P17014 697 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 KCNA3P22001 575 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 NEK4P51957 841 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 TLE1Q04724 770 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 AMOTQ4VCS5 1084 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 FNBP1LQ5T0N5 605 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 DEPDC1Q5TB30 811 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 FKBP9P1Q75LS8 142 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 RNF180Q86T96 592 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 FGFBP3Q8TAT2 258 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 KAT2BQ92831 832 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 CD101Q93033 1021 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 LGALS12Q96DT0 336 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 ADGRG7Q96K78 797 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 GMLQ99445 158 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 ASCL2Q99929 193 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 TUBA1CQ9BQE3 449 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 LCE3DQ9BYE3 92 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRIM15Q9C019 465 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 EVA1AQ9H8M9 152 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 PELI2Q9HAT8 420 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 FZD4Q9ULV1 537 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 MAGEA13PA6NCF6 341 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCDC85CA6NKD9 419 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 RRHO14718 337 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 KPNA6O60684 536 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 KCNJ13O60928 360 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 CRYAAP02489 173 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 CREB1P16220 341 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 CDC25CP30307 473 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 VIPR2P41587 438 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 ATRXP46100 2492 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 DRG2P55039 364 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZP1P60852 638 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 GAD2Q05329 585 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 MTA1Q13330 715 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 SNTA1Q13424 505 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 GPR18Q14330 331 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 C2orf27AQ580R0 203 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 EFHC1Q5JVL4 640 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM166AQ6J272 317 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 IGFL3Q6UXB1 125 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-162P-201ENST00000516228 AHI1Q8N157 1196 aa0.68□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms