RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	RASSF3	Q86WH2	238 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	SHC3	Q92529	594 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSFY1	Q96LI6	401 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	BBS2	Q9BXC9	721 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD248	Q9HCU0	757 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	DEC1	Q9P2X7	70 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	NCDN	Q9UBB6	729 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	CACNA1A	O00555	2505 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	RET	P07949	1114 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT5	P13647	590 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNMA1	Q12791	1236 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	MEA1	Q16626	185 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAN2A1	Q16706	1144 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	KBTBD6	Q86V97	674 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	DENND1C	Q8IV53	801 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	BHMT	Q93088	406 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	HINFP	Q9BQA5	517 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLK2	Q9NYY3	685 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCLK1	O15075	740 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGLV3-27	P01718	113 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	VWA3B	Q502W6	1294 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPXM2	Q8N436	756 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLD4	Q96BZ4	506 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	RMDN1	Q96DB5	314 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACOX2	Q99424	681 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCLK3	Q9C098	648 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDST4	Q9H3R1	872 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		13.27	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	LTF	P02788	710 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	GNA15	P30679	374 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	MFAP3	P55082	362 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPEM2	Q0P670	501 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLK5	Q496M5	336 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANO7	Q6IWH7	933 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEP68	Q76N32	757 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM110	Q86TL2	294 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	STK32A	Q8WU08	396 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	MIS12	Q9H081	205 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB23	Q9ULC3	237 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		13.27	□□□□□ -0.29

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