RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504263.1

PCAT4-201, prostate cancer associated transcript 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT4, Length 2,091 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT4-201ENST00000504263 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 KANSL3Q9P2N6 904 aa3.64□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 HEY2Q9UBP5 337 aa3.64□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FETUBQ9UGM5 382 aa3.64□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TAGLN3Q9UI15 199 aa3.64□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 POU2F3Q9UKI9 436 aa3.64□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa3.64□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 NUP50Q9UKX7 468 aa3.64□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PSMD13Q9UNM6 376 aa3.64□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa3.64□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 B2RBV5 119 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 H3BNH8 94 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TRIM77I1YAP6 450 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 KLF11O14901 512 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 MSI1O43347 362 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SULT1B1O43704 296 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FAM189A1O60320 539 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TLR2O60603 784 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 KPNA6O60684 536 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 MYO1DO94832 1006 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 DEXIO95424 95 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 NTSR2O95665 410 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CRTAMO95727 393 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 BAG2O95816 211 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 OLFM2O95897 454 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FGGP02679 453 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TFPTP0C1Z6 253 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ITIH2P19823 946 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TGM1P22735 817 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 RPA1P27694 616 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PEX2P28328 305 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 RRM2P31350 389 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PRKCIP41743 596 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ECE1P42892 770 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SLCO1A2P46721 670 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 RPL21P46778 160 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ALDH1A3P47895 512 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CLK3P49761 638 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SLC26A2P50443 739 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 BLVRAP53004 296 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PMS1P54277 932 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 HADHBP55084 474 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PRKCEQ02156 737 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GBE1Q04446 702 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 MAP2K5Q13163 448 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ATP1A4Q13733 1029 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 NCOA4Q13772 614 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SQLEQ14534 574 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TCEAL1Q15170 157 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 LONRF1Q17RB8 773 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ABCB5Q2M3G0 1257 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ATAD3BQ5T9A4 648 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FCRLBQ6BAA4 426 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 IQSEC1Q6DN90 963 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 BEND5Q7L4P6 421 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 RIC3Q7Z5B4 369 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 KRT77Q7Z794 578 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GLRX5Q86SX6 157 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 NLRP10Q86W26 655 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CHSY1Q86X52 802 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 LACC1Q8IV20 430 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ELMOD2Q8IZ81 293 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 LILRB2Q8N423 598 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF276Q8N554 614 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PLBD2Q8NHP8 589 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GSDMBQ8TAX9 411 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 JDP2Q8WYK2 163 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GLMNQ92990 594 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 DCUN1D1Q96GG9 259 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SLC39A13Q96H72 371 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 C1orf74Q96LT6 269 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SAMD11Q96NU1 681 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ALPK1Q96QP1 1244 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TUBA1CQ9BQE3 449 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CALN1Q9BXU9 219 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 KLHL25Q9H0H3 589 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ZFAND3Q9H8U3 227 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SP140LQ9H930 580 aa3.63□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
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