RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504047.1

ATXN3-208, Transcript of ataxin 3, human

TSL 3

Gene ATXN3, Length 426 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-208	ENST00000504047	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ATXN3-208	ENST00000504047	CA14	Q9ULX7	337 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ATXN3-208	ENST00000504047	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	OR2W5	A6NFC9	320 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	GLP2R	O95838	553 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	MATN1	P21941	496 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	TACR3	P29371	465 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	GALNS	P34059	522 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	PBX1	P40424	430 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	MMP13	P45452	471 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	GHRHR	Q02643	423 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	MTAP	Q13126	283 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	SEMA3B	Q13214	749 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	CSHL1	Q14406	222 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	KCNJ12	Q14500	433 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	MAP9	Q49MG5	647 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	MORN5	Q5VZ52	161 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	ANO7	Q6IWH7	933 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	GJA10	Q969M2	543 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	WDR91	A4D1P6	747 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	PRAMEF2	O60811	474 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	USP12	O75317	370 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	DUSP1	P28562	367 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	ARHGAP25	P42331	645 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	HSPA7	P48741	367 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	FHL3	Q13643	280 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	CNGA3	Q16281	694 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	MPEG1	Q2M385	716 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF626	Q68DY1	528 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	SVIP	Q8NHG7	77 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF398	Q8TD17	642 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	KIAA1191	Q96A73	305 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	SGCZ	Q96LD1	299 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	GDF15	Q99988	308 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	STK33	Q9BYT3	514 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	NUAK2	Q9H093	628 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	VPS45	Q9NRW7	570 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	VPS4A	Q9UN37	437 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	PLA2G6	O60733	806 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	CBFA2T3	O75081	653 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	ABCB4	P21439	1286 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	TEC	P42680	631 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	PLCD1	P51178	756 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF81	P51508	661 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	SLC14A1	Q13336	389 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	CBFB	Q13951	182 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	STARD3	Q14849	445 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	BRD3	Q15059	726 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	RAB30	Q15771	203 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	AWAT1	Q58HT5	328 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	MUL1	Q969V5	352 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84

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